要预防员工故意告公司加班（实际上是员工自己故意加班）的情况，公司可以从以下几个方面着手：

1. 明确加班审批流程：

   • 确立一个清晰的加班审批制度，确保所有加班都需经过上级领导的签字同意，并上报人力资源部备案。
   • 逗留时间长并不能直接认定为加班，必须有明确的加班申请和审批记录。

2. 加强沟通与监督：

   • HR部门应定期与员工及上级领导沟通，了解员工的工作状态和加班情况，及时发现并纠正恶意加班的行为。
   • 上级领导应负责员工的工作安排和业绩考核，对员工的工作时间和加班情况进行合理监督。

3. 申请特殊工时制度：

   • 根据公司的实际情况，可以考虑申请不定时工作制或综合计算工时工作制，以减少因加班费带来的风险。
   • 这些特殊工时制度需要符合相关法律法规的规定，并经过相关部门的审批。

4. 合规管理：

   • 公司应严格遵守国家关于加班的法律法规，确保员工的加班时间不超过法定限制。
   • 对于确实需要加班的情况，公司应依法支付加班费或安排调休。

5. 培养员工责任感：

   • 通过企业文化和员工培训，培养员工的责任感和职业道德，让员工理解合理加班与恶意加班的区别。
   • 鼓励员工提高工作效率，减少不必要的加班。

6. 保留证据：

   • 公司应保留好员工的加班申请、审批记录、考勤记录等证据，以备在发生纠纷时作为证明。

综上所述，预防员工故意告公司加班的情况需要从多个方面着手，包括明确加班审批流程、加强沟通与监督、申请特殊工时制度、合规管理、培养员工责任感以及保留证据等。这些措施可以帮助公司有效规避因员工恶意加班而带来的法律风险。