两个人合伙做工程购买的材料没有发票，仅有支付记录，这可能会影响后续的财务核算、税务申报以及法律纠纷的解决。具体分析如下：

一. 合规性问题

1. 发票的重要性：根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，所有单位和从事生产、经营活动的个人在购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项时，应当向收款方取得发票。发票是合法的财务报销凭证，也是税务部门监管的重要依据。
2. 无发票的风险：没有发票，就意味着这笔交易在财务上可能无法被正式认可，进而影响到合伙工程的成本核算、利润分配以及税务申报。同时，如果未来发生法律纠纷，缺乏发票作为证据，可能会增加维权难度。

二. 解决方案

1. 补开发票：首先，应尝试联系材料供应商补开发票。如果供应商同意补开，那么问题可以得到解决。但需要注意的是，补开发票时应确保发票内容真实、合法，且符合税务规定。
2. 协商处理：如果供应商无法或拒绝补开发票，合伙双方应协商处理此事。可以考虑通过其他方式证明交易的真实性，如提供支付记录、收货单、合同等证据。但这些证据在法律效力上可能不如发票。
3. 税务咨询：考虑到税务申报的合规性，建议合伙双方咨询专业税务机构或税务部门，了解无发票交易在税务处理上的具体规定和要求。

三. 法律建议

• 我建议：在未来的合伙工程中，应更加重视发票的取得和管理。在购买材料或接受服务时，应主动要求对方提供发票，并确保发票内容真实、合法。同时，合伙双方应签订详细的合伙协议，明确各自的权利和义务，以及交易凭证的取得和管理方式。
• 如有进一步需要，您可以继续咨询我关于合伙工程中的法律问题和解决方案。