靠拿国家储备费用的企业管理层拿几十万年薪，其合法性需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

一. 国家储备费用的管理原则

• 根据《中央储备粮管理条例》等相关法律法规，国家储备费用的管理应当严格遵循相关制度，确保费用的合法、合规使用。
• 国务院财政部门负责安排中央储备粮的贷款利息、管理费用等财政补贴，并保证及时、足额拨付。这确保了粮食储备费用的资金来源和及时到位。
• 中国储备粮管理总公司具体负责中央储备粮的经营管理，并对中央储备粮的数量、质量和储存安全负责，同时也负责相关费用的管理。

二. 企业管理层年薪的合法性考量

• 企业管理层的年薪水平并非由单一法规直接规定，而是受到多种因素的影响，包括企业性质、行业规范、市场情况、高管个人绩效等。
• 对于靠拿国家储备费用的企业，其管理层年薪的合法性主要取决于该年薪水平是否与企业的盈利水平、行业规范以及社会责任相匹配。
• 如果企业管理层的年薪水平过高，超出了企业的盈利水平或行业规范，且无法合理解释其高薪的合理性，那么可能存在合法性问题。

三. 具体案例分析

• 如果一个靠拿国家储备费用的企业管理层年薪高达几十万，但企业本身长期处于亏损状态，且无法合理解释高管高薪的合理性，那么这种高薪现象可能引发社会质疑，甚至涉嫌特权腐败。
• 相反，如果企业管理层的高薪能够与其对企业的贡献、行业规范以及社会责任相匹配，并且企业的盈利水平也足以支撑这样的薪资水平，那么这种高薪现象可能是合法的。

四. 我的建议

• 对于靠拿国家储备费用的企业，应当建立科学的薪酬制度，将高管薪酬与企业的实际业绩、市场竞争力以及社会责任相结合。
• 企业管理层的年薪水平应当透明化、公开化，接受社会的监督。
• 如有必要，政府和相关监管部门可以加强对这类企业高管薪酬的监管和审计，防止腐败行为的发生。

综上所述，靠拿国家储备费用的企业管理层拿几十万年薪是否合法，需要根据具体情况进行判断。如果高薪现象无法合理解释其合理性或存在违法违规行为，那么可能涉嫌违法。如有进一步需要，您可以继续咨询我。