针对您提出的“公司主犯被批捕，员工取保候审后期怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，员工被取保候审只是刑事强制措施的一种，它并不代表案件的最终结果。在取保候审期间，员工需要严格遵守相关规定，如随叫随到、不得离开规定的地方等。这是为了确保案件的顺利进行和司法程序的正常执行。

接下来，案件将进入侦查或审查起诉阶段。在这个阶段，相关机关会深入调查取证，以明确员工在公司被抓事件中的具体责任。这包括对员工的行为、动机、参与程度等进行全面审查。

根据调查结果，员工可能面临以下几种情况：

1. 若员工被判定无罪或情节不严重：

   • 取保候审将被解除，员工将不再受到刑事强制措施的约束。
   • 案件至此结束，员工无需承担刑事责任。

2. 若员工被认定有犯罪行为：

   • 案件将进入审判阶段，由法院根据案件的实际情况作出判决。
   • 可能的刑罚包括缓刑、拘役或有期徒刑等，具体取决于员工的犯罪情节和严重程度。

此外，员工在取保候审期间及后续处理过程中，还应注意以下几点：

• 积极配合司法机关的工作：包括提供必要的证据、接受询问等，以协助案件的顺利推进。
• 关注案件的进展：及时了解案件的最新动态，以便做出相应的应对。
• 遵守公司内部规定：尽管员工可能面临刑事问题，但仍需遵守公司的内部规章制度，以免受到额外的处分。

最后，需要指出的是，取保候审并不代表员工一定会被判刑。案件的最终结果取决于多种因素，包括员工的犯罪情节、证据是否充分以及法院的判断等。因此，员工在取保候审期间应保持冷静，积极配合调查，并寻求专业的法律帮助以维护自己的合法权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。