当公司主犯被批捕时，对于员工来说，可能会面临一系列的问题和挑战。以下是对员工可能关心的问题以及应对方式的详细解答：
一、劳动关系方面
劳动合同履行问题：
- 主犯被批捕后，公司可能因涉及的法律问题而陷入经营困境，如企业破产、停产等。这些状况会直接影响劳动合同的履行，员工可能会面临失业的风险。
- 在此情况下，员工应密切关注公司的动态，了解劳动合同是否还能继续履行，以及是否需要寻找新的工作机会。
解除劳动合同：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者被依法追究刑事责任的，用人单位可以解除劳动合同。但这一规定并不直接适用于员工，而是针对被追究刑事责任的劳动者。
- 如果公司决定因主犯被批捕而解除与某些员工的劳动合同，公司应依据相关法律法规和公司的规章制度进行，并确保解除过程合法、公正。
二、法律责任方面
共同犯罪问题：
- 如果员工参与了主犯的违法犯罪行为，那么员工可能会因此承担法律责任，被认定为共同犯罪。
- 员工应明确自己的法律责任，如果确实参与了违法活动，应积极配合司法机关的调查，并承担相应的法律后果。
无辜员工保护：
- 如果员工对主犯的违法犯罪行为并不知情，也没有参与其中，那么员工一般不需要承担法律责任。
- 在此情况下，员工应保留好相关证据，以证明自己与违法犯罪行为无关，并积极配合司法机关的调查工作。
三、工资福利方面
工资发放问题：
- 当公司经营异常时，员工的工资、社保等权益可能会受到影响，如工资发放可能会延迟或中断。
- 员工应密切关注公司的财务状况和工资发放情况，及时与相关部门沟通，确保自己的合法权益得到保障。
维权途径：
- 如果员工的工资、社保等权益受到侵害，员工可以通过合法途径维护自身权益，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
四、其他建议
保持冷静与理性：
- 面对公司主犯被批捕的情况，员工应保持冷静与理性，不要盲目恐慌或传播不实信息。
加强内部沟通与协作：
- 员工之间应加强沟通与协作，共同应对可能面临的挑战和问题。同时，也可以寻求外部支持，如法律咨询、心理辅导等。
关注公司后续发展：
- 员工应密切关注公司的后续发展情况，包括法律问题的处理、经营状况的改善等。这有助于员工更好地了解自己的工作环境和未来发展前景。
综上所述，当公司主犯被批捕时，员工应密切关注公司的动态和自身权益的变化情况，并采取相应的应对措施来保障自己的合法权益。同时，也要保持冷静与理性，加强内部沟通与协作，共同应对可能面临的挑战和问题。