针对“刻意隐瞒怀孕入职要求转正且才怀孕三个月要请产假，公司如何处理”的问题，以下是我的分析：

1. 公司可依据规章制度处理：

   • 首先，公司应查阅自身的员工手册、劳动合同或相关规章制度，看是否有关于员工怀孕、隐瞒怀孕情况或产假的相关规定。
   • 如果规章制度中明确规定了员工在入职时应如实告知怀孕情况，且隐瞒将构成违纪，那么公司可以依据此规定对员工进行相应的纪律处分，包括但不限于警告、罚款、解除劳动合同等。
   • 同时，如果规章制度中规定了员工请产假的具体条件和流程，公司应按照规定执行，确保员工的合法权益得到保障。

2. 考虑员工权益与公平原则：

   • 在处理此类问题时，公司应充分考虑员工的权益和公平原则。虽然员工隐瞒了怀孕情况，但这也可能是出于对个人隐私的保护或其他合理原因。
   • 因此，公司在做出决定时，应权衡员工的过错程度、对公司的影响以及员工的权益，确保处理结果既合法又合理。

3. 沟通与协商：

   • 在做出任何决定之前，公司应与员工进行充分的沟通和协商。了解员工隐瞒怀孕的原因，以及她对于请产假的具体需求和计划。
   • 通过沟通，公司可以更好地理解员工的处境，员工也能更清楚地了解公司的立场和规定。这有助于双方达成共识，避免不必要的纠纷。

4. 遵守相关法律法规：

   • 在处理此类问题时，公司必须严格遵守国家相关的法律法规，特别是关于女职工劳动保护、孕期和产期权益保护的规定。
   • 如果公司的处理决定违反了相关法律法规，那么该决定将是无效的，且公司可能需要承担相应的法律责任。

综上所述，公司在处理员工刻意隐瞒怀孕入职并要求请产假的问题时，应依据规章制度、考虑员工权益与公平原则、进行充分的沟通与协商，并严格遵守相关法律法规。如果公司有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。