法人工资长期发5000元，在税务上是合法的，因为并未超过个人所得税的起征点，所以无需缴纳个人所得税。下面我对此进行详细分析：

一. 法人工资发放与税务处理

1. 工资发放：法人作为公司的法定代表人，有权从公司获取工资。工资的具体数额应由公司内部规定或股东会决议确定，并需符合劳动法律法规的相关规定。
2. 税务处理：根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条，居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额，为应纳税所得额。由于法人工资长期发5000元，并未超过每月5000元的起征点，因此无需缴纳个人所得税。

二. 法人工资发放的法律风险

• 虽然法人工资长期发5000元在税务上是合法的，但公司应确保工资发放符合公司章程、股东会决议以及劳动法律法规的相关规定，避免引发内部纠纷或法律风险。

三. 我的建议

• 合规性审查：建议公司定期对工资发放进行合规性审查，确保工资发放符合相关法律法规和公司规定。
• 税务筹划：在合法合规的前提下，公司可以进行税务筹划，以降低税负并提高经济效益。

综上所述，法人工资长期发5000元在税务上是合法的，无需缴纳个人所得税。但公司应确保工资发放的合规性，并进行必要的税务筹划。如有进一步需要，您可以继续咨询我。