当遇到员工利用法律漏洞的情况时，公司应当采取一系列措施来妥善处理，以下是具体的处理步骤和建议：

一、明确法律依据与违规之处

首先，公司需要深入研究相关的法律法规及内部规章制度，确保对员工的行为有明确的法律依据。通过仔细分析员工的具体行为，清晰地找出其中违法或违规的地方，为后续处理提供有力的支持。

二、坦诚沟通与警示

接下来，公司应与该员工进行坦诚的沟通。在沟通过程中，要明确指出员工行为的不当之处以及可能带来的严重后果，使其充分认识到自身行为的错误性和危害性。同时，也要给予员工改正的机会，并告知其如不及时改正将面临的处罚。

三、依法依规处理

若员工在沟通后仍然不改正其行为，公司应依据内部规章制度给予相应的处罚。处罚措施可以包括警告、罚款、降职等，具体根据违规情节的严重程度来确定。在处理过程中，要确保处罚的公平性和公正性，避免引发员工的不满和抵触情绪。

四、严重违规行为的处理

对于涉及严重违法违规行为的员工，公司应保留好相关证据，并及时向有关部门报案。通过法律途径来解决问题，维护公司的合法权益和正常秩序。同时，公司也要积极配合有关部门的调查工作，提供必要的协助和支持。

五、完善内部规章制度

为了避免类似情况再次发生，公司应及时完善内部规章制度。通过梳理现有的制度漏洞和风险点，制定更加严密和具有针对性的规定。同时，也要加强对员工的法律培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识。

六、加强监督与预防

最后，公司应加强对员工行为的监督和预防。通过建立健全的监督机制，定期对员工的行为进行审查和评估。对于发现的潜在风险和问题，要及时采取措施进行纠正和预防，确保公司的合法权益和正常秩序得到有力保障。

综上所述，处理员工利用法律漏洞的问题需要公司采取多种措施来综合应对。通过明确法律依据、坦诚沟通、依法依规处理、完善内部规章制度以及加强监督与预防等措施，可以有效地解决这一问题并维护公司的合法权益和正常秩序。