在合同诈骗案件中，员工在不知情的情况下会如何，这是一个涉及法律责任认定的问题。以下是对此问题的全面分析：

结论前置

如果员工在合同诈骗案件中确实不知情且没有参与实施诈骗行为，通常不会被认定构成犯罪，因此也就不会被判刑。但员工仍需配合相关部门的调查，以证明自己的不知情和未参与。

详细分析

1. 不构成犯罪的理由：

   • 主观故意要件缺失：根据《中华人民共和国刑法》及相关刑法理论，构成犯罪需具备主观故意或过失等主观要件。若员工对合同诈骗行为确实不知情，即缺乏犯罪的主观故意，则不构成合同诈骗罪，无需承担刑事责任。
   • 罪刑法定原则：法律明文规定为犯罪行为的，才能依照法律定罪处刑。员工在不知情的情况下，没有诈骗的主观故意，因此不能构成诈骗罪，不应受到刑事处罚。

2. 员工角色与责任：

   • 若员工仅按公司指示或上级要求执行工作，且对诈骗行为一无所知，通常不被视为合同诈骗罪的共犯。
   • 单位犯罪时，主要刑事责任由公司及直接负责的主管人员和其他直接责任人员承担，员工若未参与或不知情，则不追究刑事责任。

3. 配合调查义务：

   • 即使员工不知情且无需承担刑事责任，仍需配合司法机关或相关部门的调查工作，提供公司业务状况、工作流程等信息，以协助查清事实。

4. 可能存在的特殊情况：

   • 尽管员工声称不知情，但如案件存在线索或证据使司法机关有合理理由怀疑员工应知情或实际参与诈骗，司法机关将进行深入调查。例如，员工业务内容与诈骗行为密切相关、工作表现异常、获取不合理高额报酬等，均可能引起怀疑。
   • 经调查，若员工实际上对诈骗行为知情或其行为对诈骗起到帮助作用，可能被认定为合同诈骗罪的共犯，需承担相应刑事责任。

5. 民事领域责任：

   • 在民事领域，若员工的工作成果被用于诈骗行为，但员工能证实自身无过错，如未参与诈骗策划、实施等，则不应承担民事赔偿责任。

总结与建议

综上所述，合同诈骗案件中员工的法律责任需根据其是否知情及参与程度综合判断。员工应确保自身行为合法合规，避免卷入诈骗行为，并在必要时积极配合调查以维护自身权益。如有任何疑虑或担忧，建议直接向我咨询，我将为你提供专业的法律意见和帮助。