关于公司员工中午下班骑自行车出厂在公路上被机动车撞了公司是否有责任的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
结论前置
公司是否承担责任，主要取决于事故的具体情况和是否满足工伤的认定条件。如果员工在交通事故中不负主要责任，且事故发生在合理时间、路线的上下班途中，那么该事故有可能被认定为工伤，公司需承担相应的工伤保险责任。反之，如果员工负主要或完全责任，或者事故不符合工伤认定条件，公司则通常无需承担责任。
具体分析
工伤认定条件：
- 根据《工伤保险条例》第十四条第六款规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害的，应当认定为工伤。
- 因此，要判断公司是否有责任，首先需确认事故是否满足工伤认定条件，即员工是否负主要责任，以及事故是否发生在上下班途中。
公司责任分析：
- 员工不负主要责任：如果员工在交通事故中不负主要责任，且事故发生在合理时间、路线的上下班途中，公司需为员工申请工伤认定，并承担工伤保险责任，包括支付停工留薪期工资、医疗费用等。
- 员工负主要或完全责任：如果员工在事故中负主要或完全责任，那么该事故通常不被认定为工伤，公司无需承担工伤相关责任。
- 特殊情况：即使员工负主要责任，但如果公司有过错间接导致事故发生（如公司未提供安全出行环境、未进行必要的安全教育等），公司可能基于其他法律关系承担民事责任。
实际操作建议：
- 员工在发生交通事故后，应及时报警并保留现场证据，以便后续进行工伤认定和责任划分。
- 公司应积极配合员工进行工伤认定申请，并按照规定支付相关费用。
- 如果对责任认定或公司责任存在争议，员工可以向我咨询，以便获得更专业的法律意见和支持。
综上所述，公司员工中午下班骑自行车出厂在公路上被机动车撞了，公司是否有责任取决于事故的具体情况和是否满足工伤的认定条件。如果员工不负主要责任且事故发生在上下班途中，公司需承担工伤保险责任；反之，公司则通常无需承担责任，但在特殊情况下可能需承担民事责任。