单位缴纳养老保险与灵活就业缴费的主要区别体现在以下几个方面：

一、缴费主体不同：

1. 单位缴纳：与单位建立劳动关系的劳动者，由单位办理职工参保手续，社保费用由单位和职工共同承担。
2. 灵活就业缴纳：未在单位就业的个体，可以以灵活就业人员身份自愿参保，社保费用全部由个人承担。

二、缴费基数与缴费比例不同：

1. 单位缴纳：

   • 缴费基数：由参保单位于每年规定时间内，以职工本人上年度工资收入总额为依据进行申报。
   • 缴费比例：单位承担16%，个人承担8%。

2. 灵活就业缴纳：

   • 缴费基数：通常设有多个档次，灵活就业参保人员可以根据自身情况自主选择缴费档次。
   • 缴费比例：一般为20%，全部由个人承担。

三、女性领取养老金年龄不同：

1. 单位缴纳：女工人年满50周岁，女干部年满55周岁即可领取养老金。
2. 灵活就业缴纳：女灵活就业人员需年满55周岁才能领取养老金。

四、养老待遇计发方式相同：

尽管单位缴纳与灵活就业缴纳在缴费方面存在差异，但两者的养老待遇计发方式是相同的。在缴费基数、缴费年限等因素相同的情况下，灵活就业人员享受的养老待遇与单位职工是一样的，待遇水平并不会因为缴费方式的不同而打折扣。遵循“多缴多得、长缴多得”的原则，缴费基数越高、缴费年限越长，退休后每月领到的养老金也会相对越多。

综上所述，单位缴纳养老保险与灵活就业缴费在缴费主体、缴费基数与比例、女性领取养老金年龄方面存在差异，但在养老待遇计发方式上保持一致。