针对您提出的问题“员工缴纳灵活就业公司可以不缴社保吗”，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，社会保险是法定的强制性保险，依法参加社会保险是用人单位和劳动者的法定义务。这意味着，无论员工是否以灵活就业人员身份自行参保，用人单位都不能免除其缴纳社会保险的义务。

从法律角度来看，《中华人民共和国劳动法》第七十二条规定：“用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。”《中华人民共和国社会保险法》第十条也明确规定：“职工应当参加基本养老保险，由用人单位和职工共同缴纳基本养老保险费。”这些法律条款都强调了用人单位和劳动者共同缴纳社会保险的法定责任。

在实际案例中，如果员工以灵活就业人员身份自行参保，而用人单位未依法为其缴纳社会保险，员工有权要求用人单位支付应由公司承担的社会保险费用。例如，在林某与某餐饮公司的劳动争议案中，林某多次要求公司为其缴纳职工基本养老保险，但公司未购买。林某无奈之下以灵活就业人员身份自行参保，后要求公司支付应由公司承担的部分职工基本养老保险费用。最终，仲裁委员会裁决支持了林某的诉求。

因此，即使员工以灵活就业人员身份自行参保，用人单位也不能免除其缴纳社会保险的义务。用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，而不能通过与劳动者协商或约定来规避其法定缴费义务。

综上所述，员工缴纳灵活就业并不能成为用人单位不缴社保的理由。用人单位应当严格遵守相关法律法规，依法为劳动者缴纳社会保险。