科研用地确实可以通过协议方式出让。根据公开发布的信息，如保定市自然资源和规划局以及南京市规划和自然资源局江宁分局的公告，都明确提到了科研用地的协议出让计划。这些公告是依据《协议出让国有土地使用权规定》等相关法律法规进行的，说明了在符合一定条件下，科研用地可以采取协议出让的方式。

具体来说，当某一地块被确定为科研用地，并计划通过协议方式出让时，相关部门会发布协议出让计划公告。公告中会详细列出拟协议出让地块的基本情况，包括地块位置、面积、用途等，并明确公告的时限。在公告时限内，任何单位、组织和个人（被实施联合惩戒的除外）都可以对该地块提出意向申请。

申请方式通常要求以书面方式提出，并提交相关的申请文件，如意向用地者申请书原件、有效身份证件复印件等。如果同一地块在公告时限内只有一个意向用地者，那么将采取协议方式出让；如果有两个或两个以上的意向用地者，则可能会采取拍卖方式出让。

因此，科研用地是可以协议出让的，但具体出让方式还需根据地块情况和意向用地者的数量等因素来确定。如果您对具体的科研用地协议出让计划有兴趣，建议关注当地自然资源和规划局或相关部门的公告，以获取更详细的信息。