食品小作坊证过期可能会面临一定的罚款，具体流程依据地区的管理条例和法律法规可能会有所不同，但通常遵循一般的行政处罚流程。以下是一个基于通常做法和您提供的参考信息整理的食品小作坊证过期罚款流程：

一、立案阶段

1. 发现线索：市场监督管理部门可能通过监督检查、举报投诉、其他部门移送或上级部门交办等途径发现食品小作坊证过期的线索。
2. 组织核查：自发现线索之日起15日内，市场监督管理部门会组织核查，以确认是否存在违法行为。
3. 决定是否立案：根据核查结果，市场监督管理部门会决定是否对案件进行立案处理。

二、调查阶段

1. 调查取证：案件承办人员（不少于两人）会向当事人或有关人员出示行政执法证件，并进行现场检查，记录现场情况。
2. 收集证据：现场检查情况会如实记入现场检查笔录，并由当事人签署意见并签名或盖章。
3. 陈述申辩：允许当事人进行陈述和申辩，并将其陈述申辩理由记录在案。

三、审查阶段

1. 案件审查：案件审查委员会办公室和案审会对案件的违法事实、收集的证据、办案的程序、法律适用、处罚种类和幅度等进行全面审查。
2. 提出处理意见：根据审查结果，提出处理意见。如果主要证据不足，可能会退回案件承办机构补充调查。

四、告知阶段

在送达行政处罚告知书的同时，告知当事人享有陈述申辩和要求听证等权利。

五、决定阶段

1. 决定处罚：根据案件审理情况和告知后当事人的陈述申辩理由，决定是否给予行政处罚。
2. 制作处罚决定书：如果需要给予行政处罚，会制作行政处罚决定书，载明违法事实和证据、处罚依据和内容、申请行政复议和提起行政诉讼的途径和期限等内容。

六、送达阶段

行政处罚决定书应在7日内送达当事人。

七、执行阶段

1. 督促履行：督促当事人履行生效的行政处罚决定。
2. 申请强制执行：对逾期不履行行政处罚决定的，依照《行政强制法》的规定申请行政强制执行。

八、其他责任

根据法律法规规章文件的规定，履行其他相关责任。

此外，具体的罚款金额和处罚措施会根据不同地区的管理条例和法律法规有所不同。例如，在某些地区，如新疆维吾尔自治区，未取得登记证从事生产经营活动的食品小作坊可能会面临一千元以上五千元以下的罚款。因此，建议食品小作坊经营者密切关注当地的市场监督管理部门公告和法规变化，确保及时办理相关证件和手续，避免不必要的法律风险和罚款。