申请辞职后，工资是应当全部发放的，这是基于我国劳动法的明确规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、工资发放的基本原则
根据我国《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，只要您已经为用人单位付出了劳动力，无论是否辞职，用人单位都有义务按时足额支付您的工资。
二、辞职后的工资处理
全额支付：在辞职的情况下，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者的工资。这是法律规定的用人单位的责任，确保劳动者在离职后能够及时获得应得的报酬。
特殊情况：若因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位有权从工资中扣除部分费用，但每月扣除的部分不得超过当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。这是为了保障劳动者的基本生活需求，同时给予用人单位一定的经济补偿。
三、未足额支付工资的处理
如果用人单位在辞职后未足额支付工资，劳动者可以采取以下措施维护自己的权益：
协商：首先尝试与用人单位进行协商，要求其支付足额工资。
投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权责令用人单位限期支付工资，并可能对逾期不支付的情况处以罚款。
仲裁与诉讼：如果投诉仍未解决问题，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁结果不服的，还可以在规定时间内向人民法院提起诉讼，以法律手段维护自己的合法权益。
综上所述，申请辞职后，工资是应当全部发放的。如果遇到用人单位未足额支付工资的情况，劳动者应依法采取相应措施维护自己的权益。