针对建筑在耕地上的违章住宅问题，根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，此类建筑是无法通过办理手续合法化的。以下是详细的解答和建议：

一、法律依据与处理原则

• 法律依据：《土地管理法》明确规定，国家严格保护耕地，禁止在耕地上进行非农建设，如建房等。这一法规为处理耕地上的违建提供了明确的法律基础。
• 处理原则：对于耕地上的违章建筑，应依法进行处理，旨在恢复土地原状，保护耕地资源。

二、违建处理方式与流程

1. 调查认定：

   • 发现途径：自然资源主管部门、农业农村主管部门等通过日常巡查、群众举报或卫片执法检查等途径发现耕地违建。
   • 立案与调查：对涉嫌违法的建房行为进行立案，并全面调查建房时间、地点、面积及建设主体等。
   • 违法性质认定：根据调查结果和法律法规，判断建房行为是否违法占用耕地。

2. 具体处理措施：

   • 责令停止建设：一旦认定为违法建房，立即送达《责令停止违法行为通知书》。
   • 限期拆除与强制执行：对于不符合土地利用总体规划的违建，作出《行政处罚决定书》，责令限期自行拆除并恢复土地原状。逾期不拆除的，可依法申请人民法院强制执行。
   • 没收建筑物：若违建符合土地利用总体规划，可能会被没收建筑物及其他设施。
   • 罚款：对违法建设者处以罚款，标准根据非法占用土地面积等因素确定。
   • 恢复种植条件：拆除违建后，需复垦被破坏的耕地并恢复种植条件。

3. 特殊情况处理：

   • 对于因历史原因或政策衔接导致的耕地上建房问题，可能根据当地政府政策进行妥善处理。
   • 涉及设施农业用地的，需区分是否符合设施农业用地规定，并进行相应整改或完善手续。

三、法律后果与风险

• 行政处罚：除了拆除或没收违建外，还可能面临罚款等行政处罚。
• 刑事责任：若违建行为构成犯罪，还将依法追究刑事责任。
• 经济损失与声誉影响：不及时整改或拆除违建，可能导致经济损失（如拆除费用、罚款等）和个人声誉、社会信用受损。

四、建议与提醒

• 增强法律意识：在建设前充分了解并遵守相关法律法规，确保土地使用合法合规。
• 及时沟通解决：已存在违建房屋的情况时，应尽快与相关部门沟通并寻求解决方案。
• 严格遵守规定：个人应自觉遵守土地管理法规，共同维护良好的土地管理秩序和耕地资源安全。

综上所述，建筑在耕地上的违章住宅必须依法进行处理。建议相关个人或单位积极配合相关部门的工作，及时纠正违法行为，以减轻可能的法律后果和经济损失。同时，也提醒广大民众在土地使用上务必遵法守规，共同守护宝贵的耕地资源。