面对员工因考勤扣款而采取报复行为的情况，作为雇主或管理者，你应当采取一系列措施来妥善处理。以下是我的建议：

1. 明确公司政策与沟通：

   • 首先，确保公司的考勤制度和扣款政策是明确、合理且符合法律法规的。
   • 与员工进行坦诚沟通，解释考勤制度的重要性和扣款政策的合理性，确保员工理解并接受。

2. 调查与核实：

   • 对于员工的报复行为，应进行详细调查，包括收集证据、了解事情经过等。
   • 核实报复行为的具体表现和影响，以便后续采取针对性的措施。

3. 依法处理：

   • 如果员工的报复行为构成了违纪或违法行为，如诽谤、骚扰、破坏公司财物等，应依据公司规章制度和法律法规进行严肃处理。
   • 必要时，可寻求法律援助或报警处理。

4. 加强员工关怀与辅导：

   • 了解员工迟到的原因，是否存在个人困难或工作压力等，给予必要的关怀和支持。
   • 提供辅导和培训，帮助员工提升时间管理能力和职业素养。

5. 完善考勤与激励机制：

   • 考虑调整考勤制度，使其更加人性化，如设置弹性工作时间、设立奖励机制等。
   • 通过正面激励引导员工遵守考勤制度，提高工作积极性和效率。

6. 建立畅通的反馈渠道：

   • 鼓励员工提出对考勤制度和扣款政策的意见和建议，及时回应并合理调整。
   • 建立有效的投诉机制，让员工在遇到问题时能够有途径表达并寻求解决。

综上所述，处理员工因考勤扣款而报复的情况需要综合考虑多个方面，包括明确政策、调查核实、依法处理、加强关怀、完善制度以及建立反馈渠道等。如果你在这个过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。