您好，关于您提出的“入职三个月缴纳社保是否合法”的问题，我可以明确地告诉您，这种做法是不合法的。

根据《中华人民共和国社会保险法》第五十八条的规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。这意味着，从员工入职的那一刻起，用人单位就有义务在三十天内为其办理社保登记并缴纳社保费用，这一规定并不因员工处于试用期而有所改变。

试用期是劳动合同期限的一部分，员工在试用期内同样享有与正式员工相同的权益，包括社保权益。因此，用人单位不能以试用期为由，拖延或拒绝为员工缴纳社保。

如果用人单位在员工入职三个月后才为其缴纳社保，这明显违反了法律规定。员工有权要求用人单位补缴劳动关系存续期间的社保费用，并可以向当地的社会保险经办机构或劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。

总之，入职三个月缴纳社保是不合法的，用人单位应当自用工之日起三十日内为员工办理社保登记并缴纳社保费用。希望这个解答能够帮助您更好地理解社保缴纳的相关规定。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。