若公司合法合规地以美元发放工资，员工需按实际收入申报纳税；若公司违规操作，员工可要求整改或向相关部门投诉。以下是具体分析：

1. 合法合规发放美元工资的情况
   若公司具备外汇支付资质（如经外汇管理部门批准），且与员工在劳动合同中明确约定以美元支付工资，则属于合法行为。此时员工需注意：

   • 税务处理：需按实际收到的美元金额，按国家外汇牌价折算成人民币申报个人所得税，公司有代扣代缴义务。
     
   • 外汇管理：员工需遵守个人外汇管理规定，如每年购汇额度限制（目前为等值5万美元/年），超出部分需提供合法证明材料。
     
   • 合同条款：建议员工仔细审查劳动合同中关于工资支付方式、汇率调整机制等条款，避免因汇率波动产生纠纷。

2. 公司违规发放美元工资的情况
   若公司未经批准擅自以美元支付工资，可能涉及以下法律风险：

   • 外汇违规：公司可能因违反外汇管理规定被外汇管理部门处罚（如罚款、没收违法所得）。
     
   • 税务风险：公司若未代扣代缴个人所得税，员工可能面临补缴税款、滞纳金甚至罚款的风险。
     
   • 员工权益保护：员工可要求公司整改，以人民币重新支付工资；若公司拒绝，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

3. 实务建议

   • 员工角度：
     
     • 保留工资发放记录（如银行流水、工资条），明确美元金额及折算汇率；
       
     • 若发现公司违规操作，及时与公司沟通或寻求法律帮助；
       
     • 关注外汇政策变化，避免因个人外汇操作违规影响信用记录。
       
   • 公司角度：
     
     • 确保外汇支付资质合法，避免因程序瑕疵导致行政处罚；
       
     • 在劳动合同中明确工资支付方式、汇率调整机制等条款，减少纠纷风险；
       
     • 定期向员工宣导外汇及税务政策，确保合规操作。

若您遇到具体问题（如公司拒发人民币工资、税务争议等），可进一步向我说明细节，我将结合具体场景为您提供针对性建议。