结论前置：补偿标准文件虽然规定了5年的期限，但已过4年多仍然可能是合法的，具体要看该文件的具体内容以及相关法律法规的规定。
分析说明：
文件有效期解读：首先，我们要明确这个“补偿标准文件”中规定的5年期限是指什么。如果这是指文件的有效期或执行期，那么理论上在5年期限内该文件都是有效的。即使已经过了4年多，只要还在5年的期限内，该文件就仍然具有法律效力。
法律法规支持：其次，我们要查看是否有相关的法律法规对这个文件的期限进行了规定或限制。如果法律法规没有明确规定该文件过期后自动失效，那么该文件在5年期限内就仍然是有效的。
实际情况考量：另外，我们还需要考虑实际情况。比如，这个文件是否已经被新的文件所替代或废止？如果文件内容已经过时，是否还有实际执行的意义？这些都是影响文件是否合法的实际因素。
总结：
因此，补偿标准文件虽然规定了5年的期限，但已过4年多并不一定就意味着它不合法了。我们需要具体查看文件的内容、相关法律法规的规定以及实际情况来综合判断。如果你对这个文件的具体法律效力存在疑问，建议你可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。