总公司交社保、分公司发薪的做法，在符合特定条件的情况下是合法的。具体分析如下：

1. 法律关系层面
   根据《社会保险法》和《劳动合同法》，社保缴纳地与工资发放地可以分属不同主体，但需满足以下条件：
   

• 劳动关系主体一致：员工必须与总公司签订劳动合同，形成劳动关系。此时分公司发薪属于总公司内部资金调配行为，不违反法律。
  
• 社保缴纳地合规：总公司需在注册地或实际经营地为员工缴纳社保，且缴纳基数需符合当地规定。若分公司所在地社保政策更优惠，需通过总公司异地缴纳备案或调整劳动关系主体（如与分公司签约）实现合规。

1. 实务操作风险点
   

• 劳动合同主体与社保缴纳主体不一致：若员工与分公司签约，但由总公司缴纳社保，可能被认定为“未依法缴纳社保”，员工可据此主张经济补偿或要求补缴。
  
• 工资发放与个税申报主体不一致：分公司发薪但未在当地申报个税，可能涉及税务合规问题，需确保工资发放与个税申报主体统一。
  
• 跨地区社保转移问题：若员工未来需转移社保关系，可能因缴纳地与劳动关系地不一致导致手续复杂化。

1. 合规建议
   

• 明确劳动关系主体：在劳动合同中清晰约定用工单位（如总公司）和发薪单位（如分公司），避免主体混淆。
  
• 统一社保与个税缴纳地：优先选择与劳动关系主体一致的地区缴纳社保和申报个税，降低合规风险。
  
• 完善内部制度：通过书面协议明确总公司与分公司在社保缴纳、工资发放中的权责，避免纠纷。

若您公司存在此类操作，建议进一步核查劳动合同、社保缴纳记录及工资发放凭证，确保全流程合规。如有具体案例或细节需要分析，可直接向我咨询。