针对您提出的“劳动合同签的总公司，社保缴纳在分公司是否合法”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
结论前置：在符合一定条件下，劳动合同签的总公司而社保缴纳在分公司是合法的。这一结论主要基于分公司与总公司的法律关系、合同约定以及社保缴纳的相关法律法规。
法律依据与实际情况分析：
分公司与总公司的法律关系：
- 分公司作为总公司的附属机构，通常不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。这意味着，从法律层面讲，分公司和总公司被视为一个整体，因此，由总公司为分公司员工缴纳社保并不违反法律的强制性规定。
社保缴纳的法律规定：
- 根据《中华人民共和国社会保险法》等相关法律法规，用人单位有义务为职工缴纳社保费，但并未明确规定必须由签订劳动合同的用人单位直接缴纳。这为总公司为分公司员工缴纳社保提供了法律上的可能性。
合同签订与社保缴纳的分离：
- 在实际操作中，由于管理效率、成本控制等因素，许多企业选择由总公司统一为员工缴纳社保，无论员工是与总公司还是分公司签订的劳动合同。这种做法在社保经办机构通常是得到认可的，只要确保社保缴纳的合规性和准确性。
实际操作中的注意事项：
- 尽管这种做法在法律上可行，但企业仍需注意以下几点：
- 确保分公司具备相应的主体资格，如已依法取得营业执照或登记证书。
- 在劳动合同或相关协议中明确约定社保缴纳的责任主体和方式，以避免潜在的劳动争议。
- 关注不同地区社保政策和待遇标准的差异，确保员工在不同地区的社保权益得到妥善保障。
- 与当地社保经办机构保持沟通，确保社保缴纳操作符合当地政策规定。
建议与措施：
- 明确合同约定：在签订劳动合同时，应明确约定社保缴纳的责任主体和方式，以避免后续争议。
- 加强内部管理：建立健全总分公司间的管理制度和协调机制，确保社保缴纳等操作的一致性和规范性。
- 关注政策变化：密切关注当地社保政策的变化，及时调整社保缴纳方案，以适应政策要求。
- 员工沟通与培训：及时向员工说明社保缴纳情况，确保员工了解并同意相关安排，减少因信息不对称引发的纠纷。
综上所述，劳动合同签的总公司而社保缴纳在分公司，在符合法律规定和合同约定的情况下是合法的。企业在实际操作中应确保合规性，并明确各方权益和义务，以避免潜在的法律风险。