针对您提出的问题“总公司签劳动合同可在分公司缴纳社保吗，且分公司没有独立运营的能力”，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，当劳动者与总公司签订劳动合同时，按照常规做法和法律规定，社会保险的缴纳通常应由总公司负责。这是因为分公司往往并不具备独立的法人资格，其运营和管理通常是由总公司来统一进行的。

从法律层面来看，《劳动合同法》以及相关的社会保险法规都强调了用人单位（在这里即总公司）应当为其职工办理社会保险登记并缴纳社会保险费。如果分公司没有依法取得营业执照或者登记证书，那么它本身并不具备作为用人单位与劳动者签订劳动合同并缴纳社保的资格。即使分公司有资格与劳动者签订劳动合同（在依法取得相关证照的情况下），由此产生的法律责任也应当由总公司来承担。

再者，从实际操作的角度来看，将社保缴纳放在总公司进行，有助于确保社保政策的统一执行和社保费用的及时缴纳，从而保障劳动者的合法权益。如果允许在分公司缴纳社保，可能会因为分公司运营能力的差异、管理水平的不同等因素，导致社保政策执行不到位或社保费用缴纳不及时等问题。

因此，结合上述分析，我们可以得出结论：当劳动者与总公司签订劳动合同时，社会保险的缴纳应由总公司负责，而不应由没有独立运营能力的分公司来缴纳。这样的做法既符合法律规定，也有利于保障劳动者的合法权益和社保政策的统一执行。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。