在自然灾害导致休假的情况下，员工是否发工资需视具体情况而定，但通常情况下，员工在自然灾害休假期间是有权获得工资的。以下从不同角度进行详细分析：
法律法规层面：
- 根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。这意味着，如果自然灾害导致单位停工、停产，但在一个工资支付周期内（通常是一个月），员工应获得全额工资。
- 若停工、停产超过一个工资支付周期，且劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准。若劳动者没有提供正常劳动，用人单位应按有关规定支付劳动者生活费，生活费可以低于最低工资标准。但具体标准可能因地区而异，需参照当地的相关规定。
劳动合同与单位规章制度层面：
- 劳动合同中可能明确规定了自然灾害等不可抗力情况下的工资支付条款。如果合同中有相关规定，则按照合同执行。
- 单位规章制度也可能对自然灾害休假期间的工资支付做出规定。如果规章制度合法且经过民主程序制定，且已告知员工，则同样具有法律效力。
实际情况与协商层面：
- 在实际操作中，单位可能会根据自然灾害的严重程度、影响范围以及单位的实际情况，与员工进行协商，确定休假期间的工资支付方案。
- 如果单位因自然灾害遭受重大损失，确实无力支付员工工资，也可以与员工协商延期支付或部分支付工资。但这种情况需要得到员工的同意，并尽可能保障员工的基本生活需求。
建议与注意事项：
- 对于员工而言，如果自然灾害导致休假，首先应查看劳动合同和单位规章制度中关于工资支付的规定。
- 如果合同或规章制度中没有明确规定，或者规定不明确，可以与单位进行协商，了解休假期间的工资支付方案。
- 如果单位拒绝支付工资或支付方案不合理，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
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