员工请病假期间，工资扣除需根据病假时长、医疗期规定及地方性法规综合判断，具体如下：

1. 医疗期内的病假工资
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期内，企业需按以下标准支付病假工资：

   • 基础标准：病假工资或疾病救济费不得低于当地最低工资标准的80%（部分地区如上海明确规定此标准）；
     
   • 合同约定优先：若劳动合同或集体合同中约定的病假工资高于法定标准，按约定执行；
     
   • 特殊情形：若员工因工负伤或患职业病，医疗期内工资按工伤保险相关规定全额支付，不适用上述扣除规则。

2. 医疗期外的病假工资
   医疗期满后，若员工仍需病假，企业可按以下方式处理：

   • 协商解除合同：企业可与员工协商解除劳动合同，并支付经济补偿；
     
   • 停发工资：若员工未提供劳动能力鉴定证明且拒绝返岗，企业可停发工资，但需避免违法解除风险；
     
   • 地方性规定：部分地区（如广东）规定，医疗期满后仍需病假的，企业可按不低于最低工资标准的60%支付生活费。

3. 病假工资的扣除限制

   • 最低工资保障：即使扣除后，员工实得工资不得低于当地最低工资标准的80%（医疗期内）或地方规定的其他比例（如医疗期外）；
     
   • 禁止全额扣除：企业不得以“事假”名义将病假工资全额扣除，否则可能构成未及时足额支付劳动报酬，员工可据此主张被迫解除劳动合同并要求经济补偿。

建议：

• 企业应制定明确的病假管理制度，并在劳动合同或规章制度中约定病假工资标准；
  
• 员工请病假时，企业可要求提供医疗机构出具的病假证明，以核实病假真实性；
  
• 若对病假工资计算或医疗期认定存在争议，可结合地方性法规进一步核实。
  

如有具体案例或地方性规定需要进一步分析，可直接向我咨询。