公休日一般不应扣绩效工资，但具体是否扣除需依据劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律法规层面
《中华人民共和国劳动法》的相关规定：
- 根据《劳动法》第四十四条，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这里明确的是，休息日（即公休日）工作应支付加班费，但并未直接规定公休日是否应扣绩效工资。
- 然而，从劳动法的立法精神来看，劳动者在公休日享有休息的权利，除非因工作需要被安排加班并获得相应补偿，否则不应因未工作而受到经济上的惩罚。
《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定：
- 劳动合同法第三条规定，订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。这意味着，劳动合同中的条款，包括关于绩效工资的扣除，应当遵循公平原则，不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了公休日不扣绩效工资，那么公司就应当遵守这一规定。
二、劳动合同与公司规章制度层面
劳动合同的约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定了公休日不扣绩效工资，那么用人单位就应当按照合同约定执行。
- 如果劳动合同中没有明确规定，或者规定模糊不清，那么就需要参考公司规章制度或相关法律法规进行判断。
公司规章制度的规定：
- 公司规章制度是用人单位为了规范内部管理而制定的，对劳动者具有约束力的规范性文件。如果公司规章制度中明确规定了公休日不扣绩效工资，那么劳动者就有权要求用人单位遵守这一规定。
- 如果公司规章制度中规定了公休日扣绩效工资，但这一规定违反了法律法规的强制性规定或劳动合同的约定，那么这一规定就是无效的，劳动者有权拒绝执行。
三、实际操作与建议
查看劳动合同和公司规章制度：
- 劳动者首先应当查看自己的劳动合同和公司规章制度，了解其中关于公休日绩效工资扣除的具体规定。
与用人单位协商：
- 如果发现劳动合同或公司规章制度中存在不合理的规定，劳动者可以与用人单位进行协商，要求修改或废除这些规定。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
举例说明：假设某公司规章制度中规定，员工在公休日未出勤将扣除当月绩效工资的20%。然而，这一规定并未在劳动合同中明确约定，且违反了劳动法关于劳动者休息权的规定。在这种情况下，劳动者有权拒绝执行这一规定，并可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总结与建议：公休日一般不应扣绩效工资，但具体是否扣除需依据劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规综合判断。如果您对此有疑问或发现用人单位存在不合理规定，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。