公休假扣绩效工资通常是不合法的，以下从多个角度为你详细分析：

法律规定明确公休假权益

1. 《职工带薪年休假条例》第二条明确规定，连续工作1年以上的职工享受带薪年休假，单位应当保证职工享受年休假，并在年休假期间给予与正常工作期间相同的工资收入。这里的“工资收入”是一个广义概念，涵盖了基本工资、奖金、津贴以及绩效工资等各种形式的报酬。所以，从法律层面来讲，职工在公休假期间应享受与正常工作期间相同的绩效工资待遇。
2. 《企业职工带薪年休假实施办法（2008年版）》第十一条进一步细化了相关规定，指出计算未休年休假工资报酬的日工资收入按照职工本人的月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算。其中所称月工资是指职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资，且职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。实行计件工资、提成工资或者其他绩效工资制的职工，日工资收入的计发办法也按照此规定执行。这再次强调了年休假期间工资收入的完整性，包括绩效工资。

绩效工资的发放原则

绩效工资作为职工工资的一部分，其发放应遵循公平、合理的原则，并与职工的工作表现和业绩紧密相关。然而，在公休假期间，尽管职工没有实际提供劳动，但这是法律赋予的休息权利，不能因此而否定其在正常工作期间的表现和业绩。所以，绩效工资在公休假期间仍应按时足额发放。

特殊情况的合法性判断

1. 特殊绩效工资核算方式：若单位的绩效工资核算方式严格依据实际工作成果或工作量，且在规章制度中有明确规定并事先告知职工，同时这种规定不违反法律法规的强制性规定，那么在极少数情况下，公休假期间可能不发放绩效工资。但这种情况需要单位有明确的制度依据，并确保制度的合法性和合理性。例如，某单位规定绩效工资完全按照当月实际完成的业务量计算，且该规定在入职时已明确告知员工并写入规章制度，若员工公休假期间确实没有业务量，那么可能不发放这部分绩效工资。不过，这种规定在实践中很容易引发争议，需要谨慎使用。
2. 劳动合同约定：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，如果劳动合同中明确约定了绩效工资的具体标准和发放条件，且公休期间不属于绩效工资发放的范围，那么用人单位在公休期间扣除绩效工资可能是合法的。但前提是劳动合同中的约定必须明确、具体，且不得违反相关法律法规。比如，劳动合同中约定绩效工资只与当月实际出勤工作天数挂钩，那么公休假期间扣除绩效工资可能符合合同约定。但这种约定如果导致员工在公休假期间的工资低于法定标准，仍然是违法的。

违法后果

如果用人单位无故克扣职工年休假期间的绩效工资，将违反《中华人民共和国劳动法》的相关规定。劳动行政部门有权责令用人单位支付被克扣的工资报酬、经济补偿以及赔偿金，以维护职工的合法权益。例如，劳动行政部门可以要求用人单位按照被克扣绩效工资的一定比例（如50% - 100%）支付经济补偿金，同时如果给职工造成了其他损失，还可能需要支付赔偿金。

建议

1. 对于职工：如果你遇到公休假被扣绩效工资的情况，首先可以查看单位的规章制度和劳动合同中是否有相关约定。如果没有合理依据，你可以与单位协商解决，要求单位补发被克扣的绩效工资。如果协商不成，你可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
2. 对于用人单位：应当严格遵守相关法律法规，确保职工在公休假期间享受与正常工作期间相同的工资待遇，包括绩效工资。同时，在制定内部规章制度或劳动合同时，也应充分考虑职工的合法权益，确保制度的合法性和合理性。如果确实有特殊情况需要调整绩效工资发放方式，应事先与职工充分沟通，并按照法定程序进行修改和完善。

如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，可以直接向我咨询。