结论：消防部门让4S店进行车辆自燃鉴定，这一做法本身并不直接涉及违法性判断，但关键在于鉴定程序是否合法、鉴定机构是否具备相应资质以及鉴定过程是否遵循了相关法律法规。以下从多个角度进行详细分析：

1. 鉴定程序的合法性：

   • 消防部门在处理火灾事故时，有权要求相关单位或个人配合进行火灾原因的调查和鉴定。这是消防部门履行其职责的一部分，旨在查明火灾原因，预防类似事故再次发生。
   • 如果消防部门认为4S店具备进行车辆自燃鉴定的专业能力和资质，且鉴定过程能够遵循相关法律法规和程序要求，那么要求4S店进行鉴定是合法的。

2. 鉴定机构的资质：

   • 进行车辆自燃鉴定的机构必须具备相应的资质和认证。这通常包括专业的技术人员、必要的检测设备和符合标准的鉴定程序。
   • 如果4S店不具备这些资质，那么其进行的鉴定可能不被认可，甚至可能构成违法行为。因此，在选择鉴定机构时，消防部门应确保其具备合法资质。

3. 鉴定过程的合规性：

   • 鉴定过程必须遵循相关法律法规和程序要求。这包括鉴定方法的科学性、鉴定数据的准确性、鉴定结论的合理性等。
   • 如果鉴定过程存在违规行为，如数据造假、方法不当等，那么鉴定结论将不可靠，甚至可能误导消防部门的调查和判断。

4. 法律后果与救济途径：

   • 如果车主对4S店的鉴定结论有异议，可以要求消防部门重新组织鉴定或委托其他具备资质的鉴定机构进行鉴定。
   • 如果车主认为消防部门或4S店在鉴定过程中存在违法行为，可以向相关部门投诉或寻求法律救济。例如，可以向当地消防部门、市场监管部门或司法机关反映情况，要求依法处理。

建议：

• 对于车主而言，如果车辆发生自燃并报消防后，消防部门要求4S店进行鉴定，车主应首先确认4S店是否具备相应资质，并了解鉴定过程是否合规。
• 如果车主对鉴定结论有异议或认为鉴定过程存在问题，应及时向消防部门反映情况，并寻求法律帮助以维护自己的合法权益。

进一步思考：

• 在实际操作中，消防部门应加强对鉴定机构的选择和监管，确保鉴定结论的准确性和可靠性。
• 同时，车主也应提高自我保护意识，了解相关法律法规和程序要求，以便在车辆自燃等事故发生时能够更好地维护自己的权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。