结论前置：停工留薪期工资和三个一次性（一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金）通常可以在同一劳动仲裁申请中提出，但具体是否合并申请需结合实际情况判断。以下从法律逻辑、实务操作和风险提示三个角度展开分析：

一、法律逻辑：三项请求的关联性支持合并申请

根据《工伤保险条例》第三十三条、第三十七条，停工留薪期工资属于工伤待遇中的“工资福利保障”，而三个一次性属于“伤残补偿”，二者均基于同一工伤事实产生，且法律未禁止合并主张。实务中，劳动仲裁委通常会将同一工伤事故引发的多项请求合并审理，以提高效率。

举例说明：若劳动者因工伤导致十级伤残，停工留薪期为3个月，其可在仲裁申请中同时主张：

1. 停工留薪期工资（月工资×3个月）；
2. 一次性伤残补助金（本人工资×7个月）；
3. 一次性工伤医疗补助金（统筹地区上年度职工月平均工资×2个月）；
4. 一次性伤残就业补助金（统筹地区上年度职工月平均工资×8个月）。

二、实务操作：合并申请需注意的细节

1. 证据关联性：需提交工伤认定书、劳动能力鉴定结论书、工资流水等证据，证明停工留薪期时长、伤残等级及工资标准，避免因证据不足被驳回部分请求。
2. 仲裁请求明确性：需在仲裁申请书中分别列明各项请求的金额及计算依据，例如：
   • 停工留薪期工资：5000元/月×3个月=15000元；
   • 一次性伤残补助金：5000元/月×7个月=35000元；
   • 一次性工伤医疗补助金：7000元/月×2个月=14000元；
   • 一次性伤残就业补助金：7000元/月×8个月=56000元。
3. 时效问题：根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动仲裁时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。建议尽早申请，避免因超时效丧失胜诉权。

三、风险提示：合并申请可能面临的挑战

1. 用人单位抗辩：用人单位可能主张停工留薪期工资已支付，或对伤残等级、工资标准提出异议，需提前准备反驳证据。
2. 部分请求不成立风险：若劳动能力鉴定结论被撤销或变更，可能导致一次性伤残补助金金额调整，甚至影响其他请求的认定。
3. 执行难度：若用人单位经营困难，即使仲裁胜诉，也可能面临执行困难。建议申请仲裁时同步申请财产保全。

四、特殊情况处理

若劳动者已与用人单位签订《工伤赔偿协议》，但协议未涵盖停工留薪期工资或三个一次性，仍可单独就未涵盖部分申请仲裁。但需注意：

1. 协议若已明确放弃部分权利，可能被认定为有效；
2. 若协议显失公平（如赔偿金额低于法定标准的70%），可依据《民法典》第一百五十一条申请撤销。

建议：工伤赔偿涉及多项权利，合并申请可提高效率，但需确保证据充分、请求明确。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细方案。