在工作期间遭受第三人侵权的情况下，公司主要承担的是工伤赔偿责任，但具体责任划分需根据实际情况来确定。以下从不同角度为你详细分析：
一、工伤认定与赔偿
工伤认定：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。这包括在工作期间遭受第三人侵权的情况，只要该侵权行为与工作有关，且发生在工作时间和工作场所内，就可以申请工伤认定。
工伤赔偿：
- 一旦被认定为工伤，职工有权享受工伤保险待遇，包括医疗费、护理费、停工留薪期工资、一次性伤残补助金等。这些费用由工伤保险基金支付，如果公司未依法缴纳工伤保险费，则由公司承担这些费用。
二、公司可能承担的额外责任
安全保障义务：
- 公司作为工作场所的管理者，有义务为职工提供安全的工作环境。如果公司未能尽到安全保障义务，导致职工在工作期间遭受第三人侵权，公司可能需要承担一定的民事赔偿责任。这种责任是基于公司对职工的安全保障义务，而非直接基于侵权行为。
与第三人侵权责任的竞合：
- 在某些情况下，职工遭受的第三人侵权可能同时构成工伤和民事侵权。此时，职工可以同时主张工伤保险待遇和民事侵权赔偿。但需要注意的是，根据相关法律规定，医疗费等实际发生的费用通常不能重复获得赔偿。
三、具体案例分析
- 假设一名职工在工作期间被第三人驾驶的车辆撞伤，导致骨折。该职工可以首先申请工伤认定，并享受工伤保险待遇。同时，如果第三人存在过错（如超速、酒驾等），该职工还可以向第三人主张民事侵权赔偿。在这种情况下，公司主要承担的是工伤赔偿责任，而第三人则承担民事侵权赔偿责任。
四、法律建议
及时申请工伤认定：
- 职工在工作期间遭受第三人侵权后，应尽快向公司报告，并由公司或职工本人向社会保险行政部门申请工伤认定。这是享受工伤保险待遇的前提。
保留相关证据：
- 职工应保留与侵权行为相关的证据，如现场照片、视频、证人证言等。这些证据在后续申请工伤认定和主张民事侵权赔偿时都将起到重要作用。
咨询专业律师：
- 如果职工在工伤认定和赔偿过程中遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询。我可以根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。
总结来说，工作期间遭受第三人侵权时，公司主要承担的是工伤赔偿责任。但具体责任划分需根据实际情况来确定，包括是否尽到安全保障义务、是否存在与第三人侵权责任的竞合等。职工应及时申请工伤认定、保留相关证据，并在必要时咨询专业律师以维护自己的合法权益。