在司法实践中，若当事人主张的法律关系与审理查明的法律关系不一致，法院通常会根据查明的事实和证据，重新确定案件的法律关系，并据此进行审理和判决。以下是对此问题的详细分析：

一、法院的处理原则

1. 以事实为依据，以法律为准绳：

   • 法院在审理案件时，首要任务是查明案件事实。当当事人主张的法律关系与审理查明的事实不符时，法院会依据查明的事实，重新确定案件的法律关系。
   • 法院在确定法律关系时，会严格遵循相关法律法规和司法解释的规定，确保判决的合法性和公正性。

2. 保障当事人的诉讼权利：

   • 法院在审理过程中，会充分保障当事人的诉讼权利，包括举证、质证、辩论等权利。
   • 若当事人因法律关系认识错误而提出不当主张，法院会通过释明等方式，引导当事人正确行使诉讼权利，确保案件的公正审理。

二、具体处理方式

1. 释明与变更诉讼请求：

   • 在审理过程中，若法院发现当事人主张的法律关系与审理查明的事实不符，且可能影响案件的公正审理时，法院会向当事人进行释明，告知其法律关系认定错误可能带来的法律后果。
   • 经释明后，若当事人同意变更诉讼请求，法院会允许其变更，并按照变更后的诉讼请求继续审理。

2. 直接认定法律关系并判决：

   • 若当事人拒绝变更诉讼请求，或经释明后仍坚持原主张，但法院根据查明的事实和证据，能够确定案件的真实法律关系时，法院会直接认定法律关系，并据此作出判决。
   • 在此情况下，若当事人的原主张与法院认定的法律关系不符，其诉讼请求可能因缺乏事实和法律依据而被驳回。

三、法律后果与风险提示

1. 法律后果：

   • 若当事人主张的法律关系与审理查明的事实不符，且未根据法院释明变更诉讼请求的，其可能面临诉讼请求被驳回的风险。
   • 即便当事人变更了诉讼请求，若变更后的请求仍缺乏事实和法律依据，其同样可能面临败诉的风险。

2. 风险提示：

   • 当事人在提起诉讼时，应充分了解案件事实和法律规定，准确主张法律关系，以避免因法律关系认定错误而带来的不利后果。
   • 在审理过程中，当事人应积极配合法院的审理工作，如实陈述案件事实，提供充分证据支持自己的主张。若对法律关系认定有疑问或争议，应及时向法院提出，并寻求专业法律帮助。

总结来说，当当事人主张的法律关系与审理查明的法律关系不一致时，法院会根据查明的事实和证据重新确定法律关系，并据此进行审理和判决。当事人在提起诉讼和审理过程中应充分了解案件事实和法律规定，准确主张法律关系，并积极配合法院的审理工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。