公司让员工放假三个月是否违法，需根据具体情况综合判断，关键在于是否符合劳动合同约定、是否经过双方协商一致、是否有合理理由以及是否按规定支付工资或生活费。以下从合法与违法两种情形进行详细分析：
合法情形
双方协商一致：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者可协商变更劳动合同内容。若公司因经营困难、业务调整等原因，与员工充分沟通并达成一致后安排放假三个月，且按法律规定或双方约定支付工资待遇，此行为合法。
- 实例：公司因市场环境变化导致订单减少，提出放假方案并与员工签订协议，支付一定生活费，此情况合法。
不可抗力或特殊原因：
- 当出现自然灾害、政府行政命令等不可抗力因素导致公司无法正常运营时，放假三个月可能合法。
- 实例：突发洪水导致公司无法工作，或疫情期间政府要求停工停产，公司按要求放假均属合法。
符合停工停产规定：
- 依据《工资支付暂行规定》第十二条，非劳动者原因造成单位停工、停产的，用人单位需按规定支付工资。若公司停工停产安排员工放假，并按此规定执行，行为合法。
- 实例：公司设备检修需停工三个月，首月按合同约定支付工资，之后按月支付生活费，符合法律规定。
违法情形
未经协商擅自放假：
- 若公司未与员工协商，单方面决定放假三个月且无合理理由，可能违反劳动合同及《劳动合同法》。
- 实例：公司无故通知员工放假三个月，员工有权要求继续履行合同或赔偿。
不支付工资或生活费：
- 即使公司有合理理由放假，也必须按规定支付工资或生活费。若不支付或支付低于法定标准，行为违法。
- 实例：公司停工停产安排放假，但超过一个工资支付周期后不支付任何费用，员工可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
法律建议
- 对于公司：在安排员工放假前，应确保与员工进行充分沟通，并达成一致意见。同时，要明确放假的原因、期限以及工资或生活费的支付标准，并签订书面协议，以避免法律纠纷。
- 对于员工：若公司未经协商擅自安排放假或不支付工资或生活费，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。
综合分析，公司让员工放假三个月的合法性取决于多个因素，包括是否经过协商、是否有合理理由、是否按规定支付工资等。因此，在实际操作中，公司应确保放假行为符合法律法规和劳动合同约定，避免侵犯员工合法权益。同时，员工也应了解自身权益，如遇违法行为可及时维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。