核心结论：在第一次鉴定为轻微伤、第二次鉴定为轻伤一级，第三次受害人拒绝配合鉴定的情况下，派出所会根据现有证据材料依法处理案件，不会因受害人拒绝鉴定而直接终止程序。具体处理方式需结合案件阶段和证据情况综合判断，以下是分情况说明：

1. 案件处于侦查阶段（派出所立案后调查）

• 证据效力优先：若第二次鉴定（轻伤一级）已由合法鉴定机构出具，且程序合法（如鉴定人资质、送检材料完整等），该结论可直接作为定案依据。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第255条，鉴定意见经审查符合要求的，应当作为证据使用。
• 受害人拒绝配合的影响：若第三次鉴定是派出所基于案件需要（如对第二次鉴定有异议）启动的，受害人无正当理由拒绝配合，派出所可依据《刑事诉讼法》第52条，结合其他证据（如伤情照片、病历、证人证言等）综合认定伤情。若现有证据已充分证明轻伤一级，无需强制受害人接受第三次鉴定。
• 例外情形：若第二次鉴定存在程序违法（如鉴定机构无资质、送检材料不完整）或受害人提出合理异议（如鉴定时伤情未稳定），派出所可能需补充鉴定或重新鉴定。此时受害人拒绝配合，派出所可记录在案，但不得因此阻碍案件推进。

2. 案件已进入审查起诉或审判阶段

• 鉴定意见的审查：检察院或法院会重点审查第二次鉴定的合法性、关联性、客观性。若鉴定程序合法、结论科学，即使受害人拒绝第三次鉴定，该意见仍会被采纳。
• 补充证据的可能性：若辩护方对第二次鉴定提出质疑（如伤情变化、鉴定时机不当），法院可能要求补充鉴定或专家辅助人出庭。此时受害人拒绝配合，法院可依据《刑事诉讼法解释》第98条，结合其他证据认定事实，或直接采纳第二次鉴定结论。

3. 派出所的实务操作建议

• 固定现有证据：派出所应立即整理第二次鉴定报告、伤情照片、病历、证人证言等材料，形成完整的证据链，避免因受害人拒绝配合导致证据缺失。
• 沟通与释法：派出所可再次向受害人说明拒绝鉴定的法律后果（如可能影响其权益主张），但不得采取强制措施（如拘留、传唤）逼迫其配合。
• 程序推进：若证据充分，派出所可依法将案件移送检察院审查起诉；若证据不足，可补充调查或依据现有证据作出处理（如调解、行政处罚等）。

4. 受害人的权利与风险

• 权利：受害人有权拒绝非必要的鉴定，但需承担可能因证据不足导致诉求无法支持的风险（如刑事附带民事赔偿金额降低）。
• 风险：若第二次鉴定结论被推翻（如因程序违法），且受害人拒绝配合第三次鉴定，法院可能因证据不足不予采信其伤情主张，影响定罪量刑和赔偿。

总结：派出所不会因受害人拒绝第三次鉴定而直接终止案件，而是会依据第二次合法鉴定结论及其他证据依法处理。受害人应权衡拒绝鉴定的利弊，若对第二次鉴定有异议，可通过合法途径（如申请重新鉴定、专家辅助人出庭）维护权益，而非单纯拒绝配合。如有具体案件细节需要进一步分析，可直接向我咨询。