结论：公司效益不好且员工存在缺勤情况时，是否扣工资需依据具体情况判断，包括公司规章制度、劳动合同约定以及缺勤的性质和原因等。
分析说明：
公司规章制度与劳动合同：
- 公司通常会在规章制度或劳动合同中明确规定员工的出勤要求、缺勤的处罚措施以及工资的计算方式。如果规章制度或劳动合同中明确规定了缺勤将扣减工资，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司有权按照约定扣减工资。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位有权依法制定规章制度，并据此对员工进行管理。但规章制度必须合法、合理，且经过民主程序制定并公示，才能作为管理的依据。
缺勤的性质和原因：
- 如果员工的缺勤是由于个人原因（如迟到、早退、旷工等），且公司规章制度或劳动合同中有明确规定，那么公司有权扣减相应工资。
- 如果员工的缺勤是由于不可抗力因素（如自然灾害、突发疾病等）或公司原因（如公司安排停工、放假等）导致的，那么公司通常不应扣减工资。在这种情况下，公司应按照相关规定支付员工工资或生活费。
公司效益与工资扣减的关联性：
- 公司效益不好本身并不直接成为扣减员工工资的理由。除非公司面临严重经营困难，且经过法定程序（如与工会或职工代表协商）后，可以依法采取降低工资、轮岗轮休等措施。但即便如此，公司也不能随意扣减员工工资，必须遵循法定程序和条件。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位在面临经营困难时，应与工会或职工代表协商，采取合理措施保障员工权益。未经协商或未遵循法定程序，用人单位不得单方面降低员工工资或扣减工资。
建议与行动：
- 员工角度：如果员工认为公司扣减工资的行为不合理或违法，可以先与公司进行沟通协商，要求公司说明扣减工资的理由和依据。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 公司角度：公司应依法制定规章制度和劳动合同，明确员工的出勤要求和工资计算方式。在面临经营困难时，应积极与员工沟通协商，采取合理措施保障员工权益，避免引发劳动纠纷。
特殊场景：
- 如果公司规章制度或劳动合同中未明确规定缺勤扣减工资的情况，但公司实际执行了扣减工资的行为，员工可以要求公司补发被扣减的工资，并有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 如果公司因效益不好而采取全员降薪措施，但未经与工会或职工代表协商一致，员工同样可以拒绝降薪并维护自己的合法权益。
总结：公司效益不好且员工存在缺勤情况时，是否扣工资需根据具体情况判断。员工应了解自己的权益和公司的规章制度，必要时通过法律途径维护自己的合法权益。公司也应依法管理员工，避免引发劳动纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。