缺勤缺卡是否可以扣工资，不能一概而论，需要根据具体情况来判断，以下从不同角度进行分析：
公司规章制度：
- 若公司依法制定的规章制度中明确将考勤与工资挂钩，规定缺卡应扣减相应工资，且该规章制度已向员工公示或告知员工，那么在这种情况下，公司按照规定对缺卡员工扣工资是有依据的。
- 反之，如果公司规章制度中没有相关规定，或者规定不明确，那么公司就不能随意扣减员工工资。
缺卡原因：
- 如果员工缺卡是因不可抗力等合理原因导致，如突发疾病、遭遇自然灾害等，公司一般不应扣工资。因为这种情况下，员工并非故意缺卡，扣减工资缺乏合理性。
- 若员工缺卡是无故的，比如无故旷工、迟到等违反劳动纪律的行为，公司依据规章制度扣工资是合理的。但扣除的数额也应符合法律规定，不能随意克扣。一般来说，每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果用人单位违法扣除劳动者工资，由劳动行政部门责令限期补全，并可能面临加付赔偿金的处罚。
- 因此，建议公司在制定规章制度时，明确考勤与工资的挂钩方式，并向员工公示或告知。同时，在处理缺卡问题时，应区分缺卡原因，合理确定是否扣减工资以及扣减的数额。
可能的法律后果：
- 如果公司随意扣减员工工资，且扣减数额超过法律规定或未向员工公示规章制度，员工有权向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司补全工资并可能获得赔偿金。
综上所述，缺勤缺卡是否可以扣工资需要根据具体情况来判断。公司在处理此类问题时，应遵守相关法律法规，确保扣减工资的合法性和合理性。如果您正遇到此类法律难题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。