在劳动仲裁中，一般仲裁的是用人单位，而非用工单位，但具体需根据实际法律关系来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律概念上的区分
用人单位：根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位是指与劳动者建立劳动关系，签订劳动合同，并承担支付工资、缴纳社会保险等法定义务的主体。在劳动仲裁中，通常是将用人单位作为被申请人，来处理与劳动者之间的劳动争议。
用工单位：这一概念在劳务派遣等特定用工形式中出现。用工单位是指实际使用劳动者，但并不与劳动者直接签订劳动合同，而是与劳务派遣单位签订劳务派遣协议，由劳务派遣单位向其派遣劳动者的单位。在劳务派遣关系中，用工单位虽然实际使用劳动者，但并不承担用人单位的全部法定义务。
二、劳动仲裁中的被申请人确定
一般情况：在大多数劳动争议中，劳动者与用人单位之间存在直接的劳动关系，因此劳动仲裁的被申请人通常是用人单位。劳动者可以就工资支付、加班费、经济补偿、社会保险等争议向用人单位提出仲裁申请。
特殊情况：在劳务派遣等特定用工形式中，如果劳动者与劳务派遣单位（即用人单位）之间发生劳动争议，那么被申请人自然是劳务派遣单位。但如果争议涉及用工单位，比如用工单位未按照劳务派遣协议支付劳务费用、对劳动者造成损害等，劳动者在仲裁时可能需要将劳务派遣单位和用工单位列为共同被申请人，或者根据具体情况选择其中一方作为被申请人。不过，这并不意味着用工单位在所有情况下都会成为劳动仲裁的被申请人，关键在于争议的具体内容和法律关系。
三、实际操作中的建议
明确劳动关系：在提起劳动仲裁前，劳动者应首先明确自己与哪个单位建立了劳动关系。这通常可以通过查看劳动合同、工资支付记录、社会保险缴纳记录等证据来确定。
咨询专业律师：如果劳动者对劳动关系或仲裁被申请人存在疑问，建议咨询专业律师。律师可以根据劳动者的具体情况和证据材料，为劳动者提供准确的法律建议和仲裁策略。
准备充分证据：在提起劳动仲裁时，劳动者应准备充分的证据材料来支持自己的仲裁请求。这包括劳动合同、工资支付记录、社会保险缴纳记录、工作证、考勤记录等能够证明劳动关系和争议事实的证据。
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