结论：医药代表因专业不符合备案要求被辞退是否有赔偿，需根据具体情况判断，主要看辞退是否合法以及是否存在应支付赔偿金的情形。以下从不同角度进行分析：
一、若辞退合法，一般无赔偿
法律依据：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，如果劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同。在医药代表的情境中，若其专业确实不符合备案要求，且经过培训或调整岗位后仍无法满足要求，用人单位有权依法辞退，且无需支付赔偿金。
实际操作：
- 用人单位在辞退前，应确保已经对医药代表进行了必要的培训或调整了工作岗位，并且有充分的证据证明其仍无法胜任工作。同时，辞退程序应符合法律规定，如提前通知、支付经济补偿等（若适用）。
二、若辞退不合法，可能有赔偿
违法辞退的情形：
- 如果用人单位没有充分的证据证明医药代表不能胜任工作，或者辞退程序不符合法律规定（如未提前通知、未支付经济补偿等），则可能构成违法辞退。
赔偿标准：
- 根据《劳动合同法》第八十七条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 经济补偿的计算标准为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
实际操作建议：
- 如果医药代表认为用人单位的辞退行为违法，可以收集相关证据（如工作记录、培训记录、辞退通知等），向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付赔偿金。
三、特殊情况考虑
- 劳动合同或规章制度中的约定：如果劳动合同或用人单位的规章制度中明确规定了因专业不符合要求而辞退的具体情形和程序，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么应按照这些规定执行。
- 协商解决：在发生争议时，双方也可以尝试通过协商解决，以达成互利共赢的结果。
建议：对于医药代表而言，如果因专业不符合备案要求被辞退，首先应了解辞退的具体原因和程序是否合法。如果认为辞退不合法，可以收集相关证据并寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），以维护自己的合法权益。同时，也建议用人单位在辞退员工时严格遵守法律法规和劳动合同的约定，以避免不必要的法律纠纷。