结论：这种情况可能不合法，但需要结合具体情况进一步分析判断。以下从不同角度为你详细说明：

从社保缴费基数确定规则角度

根据相关规定，职工的社保缴费基数一般按照职工上一年度月平均工资来确定。这里的月平均工资是按照国家统计局规定列入工资总额统计的项目计算，包括工资、奖金、津贴、补贴等收入。

如果煤矿职工实际月工资达到一万多，而社保基数才三千多，明显低于其实际工资水平，这不符合社保缴费基数应与职工实际工资挂钩的原则，从规则层面来说是不合法的。不过，也存在一些特殊情况，比如新入职职工，如果其入职时间较短，可能按照首月工资或者合同约定的工资来确定缴费基数，若首月工资或合同约定工资就是三千多，那么在入职初期这种缴费基数可能是合理的，但随着工作时间增加，后续应按照实际工资调整缴费基数。

从当地社保缴费基数上下限角度

各地会规定社保缴费基数的上下限，下限一般是当地上年度职工月平均工资的60%，上限是300%。如果该职工所在地区规定的社保缴费基数下限就是三千多，而其实际工资虽然一万多，但煤矿按照下限为其缴纳社保，从表面上看似乎符合当地规定的下限标准。然而，这并不意味着这种做法完全合法，因为规定下限的目的是保障职工基本权益，同时考虑企业负担，但企业不能以此为由故意低报缴费基数，损害职工利益。如果能够证明煤矿是故意按照下限而非职工实际工资来缴纳社保，那么这种行为仍然是违法的。

从职工权益保障角度

社保对于职工来说至关重要，它关系到职工在养老、医疗、失业、工伤、生育等方面的保障。如果社保基数低于实际工资，会导致职工在享受社保待遇时受到影响。例如，退休后领取的养老金会减少，因为养老金的计算与缴费基数和缴费年限等因素相关。从保障职工合法权益的角度出发，煤矿按照远低于实际工资的基数缴纳社保是不合理的，也是不合法的。

建议：如果遇到这种情况，职工可以先与煤矿沟通协商，要求按照实际工资调整社保缴费基数。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动法律方面的问题，欢迎随时向我咨询。