结论前置：当公司代发工资发错，员工不愿退回时，公司确实可以考虑报警，但需根据具体情况判断报警的合理性与适用性。同时，公司还可以采取其他法律手段来维护自身权益。
一、报警的合理性与适用情形
恶意侵占与涉嫌犯罪：
- 如果员工明知是错误发放的工资，却故意不退还，且数额较大或持续时间较长，可能构成不当得利甚至诈骗等违法行为。此时，公司有权向公安机关报案，要求追究其法律责任。
- 若员工的行为涉及职务侵占罪（如利用职务便利将本单位财物非法占为己有）或其他犯罪行为，公司更应立即报警，由司法机关依法处理。
报警前的准备：
- 在报警前，公司应尽可能收集相关证据，如工资发放记录、银行转账凭证、与员工沟通的记录等，以证明工资发放错误及员工未退还的事实。
- 公司可以尝试与员工进行协商，明确告知其工资发放错误的情况，并要求其限期退还。这有助于维护双方的劳动关系，避免不必要的法律纠纷。
报警后的处理流程：
- 报警后，公安机关会依法受理案件，并进行调查取证。公司应积极配合公安机关的工作，提供必要的协助和证据。
- 根据调查结果，公安机关会依法作出处理决定。如果员工的行为构成违法或犯罪，将面临相应的法律制裁。
二、其他法律手段
除了报警外，公司还可以考虑通过以下方式处理工资发放错误的问题：
劳动仲裁：
- 如果公司与员工之间就工资问题存在争议，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会将根据事实和法律规定作出裁决。
提起诉讼：
- 如果仲裁结果不满意或员工不履行仲裁裁决，公司可以向人民法院提起诉讼，要求员工退还多发的工资。在提起诉讼前，公司应确保已收集到充分的证据来支持其主张。
- 法院会依据事实和法律作出公正判决，要求员工返还不当得利。若员工不履行法院判决，公司还可以申请强制执行，通过法律程序强制追回多发的工资。
向劳动监察部门投诉：
- 公司还可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位进行调查、责令改正，并依法对其作出处罚。这一途径对于规范员工行为、维护公司合法权益同样具有重要意义。
三、预防与管理建议
为避免类似问题的发生，公司应加强内部管理，完善工资核算和发放流程。具体措施包括但不限于：
- 建立严格的工资审核制度，确保工资发放的准确性。
- 加强员工培训与教育，提高员工对工资发放规定的认识和理解。
- 定期核查工资发放情况，及时发现并纠正错误。
总结与建议：面对公司代发工资发错而员工不愿退回的情况，公司应根据实际情况选择合适的法律手段进行维权。报警是一种可行的选择，但需根据具体情况判断其合理性与适用性。同时，公司还可以考虑通过劳动仲裁、提起诉讼或向劳动监察部门投诉等方式来维护自身权益。此外，加强内部管理和预防措施也是必不可少的环节，以降低类似问题的发生风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。