公司之间的借款是可以用不动产设定抵押权的，但必须满足一定的条件并遵循相应的程序。以下是对此问题的详细解析：

1. 合法的借贷关系是前提：

   • 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，公司之间为生产、经营需要订立的民间借贷合同，除存在法定无效情形外，均受法律保护。因此，公司间的借款行为必须基于合法有效的借贷合同，这是进行不动产抵押的前提基础。

2. 抵押人对不动产有处分权：

   • 用于抵押的不动产，抵押人（通常为借款人）必须对其拥有完全的所有权或合法的处分权。若不动产存在共有人，还需取得其他共有人的书面同意，以确保抵押合同的效力不受影响。同时，该不动产应具备流通和转让的属性，即非法律禁止流通或转让的财产。

3. 签订书面合同是必要步骤：

   • 为确保借贷关系和抵押关系的明确与合法，当事人应当签订书面的借款合同和抵押合同，或者在借款合同中明确约定抵押条款。抵押合同应包含被担保债权的种类和数额、债务人履行债务的期限、抵押财产的名称、数量等情况以及担保的范围等关键信息，依据《民法典》第四百条的规定执行。

4. 办理抵押登记是关键环节：

   • 以不动产设定抵押的，必须依法办理抵押登记手续。依据《民法典》第四百零二条的规定，抵押权自登记时设立。因此，仅签订抵押合同并不足以使抵押权生效，只有完成不动产抵押登记后，债权人才真正享有抵押权。当债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形时，债权人有权就该抵押不动产优先受偿。

5. 遵守法律法规的禁止性规定：

   • 在进行不动产抵押时，必须严格遵守法律法规的强制性规定和公序良俗。例如，被依法查封、扣押、监管的不动产以及学校、幼儿园、医疗机构等为公益目的成立的非营利法人的教育设施、医疗卫生设施和其他公益设施等均不得用于抵押。违反这些规定将可能导致抵押合同无效或抵押权无法实现。

法律建议：

• 在进行公司间借款并设定不动产抵押时，建议双方详细咨询专业律师，确保借贷合同和抵押合同的合法性和有效性。
• 办理抵押登记时，应前往不动产所在地的登记机构，按照规定的程序和要求进行登记，以确保抵押权的设立和行使。
• 在整个过程中，应严格遵守相关法律法规的规定，避免触犯法律红线，导致不必要的法律风险和损失。

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