已经设立抵押权的不动产不能作为公司出资。下面我将从法律角度详细解释这一结论：
法律法规依据
《中华人民共和国民法典》：
- 第四百零六条：抵押期间，抵押人可以转让抵押财产。当事人另有约定的，按照其约定。抵押财产转让的，抵押权不受影响。但抵押人转让抵押财产的，应当及时通知抵押权人。抵押权人能够证明抵押财产转让可能损害抵押权的，可以请求抵押人将转让所得的价款向抵押权人提前清偿债务或者提存。
《中华人民共和国公司法》：
- 第二十七条：股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资；但是，法律、行政法规规定不得作为出资的财产除外。
《公司登记管理条例》：
- 第十四条：股东的出资方式应当符合《公司法》第二十七条的规定，但股东不得以劳务、信用、自然人姓名、商誉、特许经营权或者设定担保的财产等作价出资。
出资的不可行性分析
抵押权的限制：
- 已设立抵押权的不动产，其所有权受到抵押权的限制。在抵押权未解除前，该不动产的处分权受到限制，不能自由转让或用于出资。
公司资本确定原则：
- 公司资本是公司对外债务的一般担保。以设有抵押权的财产作为出资标的，该财产的自由转让将受到抵押权的限制，一旦抵押权人主张优先受偿，将会危及公司财产的完整性，从而有违公司资本确定原则。
出资瑕疵风险：
- 若以抵押财产出资，未取得抵押权人同意或未按照法律规定程序进行，该出资可能被认定为存在瑕疵。这将导致公司注册资本不实，进而影响公司的信用和正常运营。
实际应用中的注意事项
- 在考虑以不动产作为公司出资时，应首先确认该不动产是否已设立抵押权。
- 若已设立抵押权，应寻求抵押权人的同意，并按照法律规定程序进行解除抵押或替换出资财产。
- 若因特殊情况需以抵押财产出资，应咨询专业律师，确保出资行为的合法性和有效性。
综上所述，已经设立抵押权的不动产不能作为公司出资。这是由法律法规的明确规定和公司的资本确定原则所决定的。在实际操作中，应严格遵守相关规定，确保公司出资的合法性和有效性。