股东在特定条件下可以用已经设定抵押的财产做公司的出资，但必须满足严格的法律要求和程序，否则将可能面临法律风险和公司运营上的不稳定。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律背景与原则
根据《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国公司法》等相关法律法规，股东可以用货币、实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资。对于已设立抵押权的财产，法律并未绝对禁止其作为出资，但因其权利受限，需满足特定条件。
二、出资的可行性与条件
取得抵押权人同意：
- 已设立抵押权的财产，其处分权受到抵押权的限制。因此，要将其用于出资，必须首先取得抵押权人的明确同意。这是确保出资行为不会损害抵押权人利益的关键步骤。若未经抵押权人同意，该出资可能被视为无效，且股东可能面临法律责任，如被要求补足出资差额或承担欺诈等刑事责任。
告知其他股东：
- 出资人应将财产已设立抵押的情况如实告知公司其他股东，以保障他们的知情权，并便于他们评估该出资对公司可能产生的影响。这是维护公司内部治理和股东权益的重要一环。
可估价与可转让性：
- 除了上述条件外，已设立抵押权的财产还需满足可以用货币估价且依法可以转让的条件。这是所有非货币财产出资的基本要求，也是确保公司能够实际获得并使用该资产的前提。
三、可能面临的风险与应对措施
出资瑕疵风险：
- 若出资人未取得抵押权人同意就以抵押财产出资，或未如实告知其他股东该财产已设立抵押的情况，该出资可能被认定为存在瑕疵。此时，公司其他股东、债权人等利害关系人有权要求出资人采取补救措施，如更换出资财产或补足出资。为避免此类风险，出资人应严格遵守法律程序，确保出资行为的合法性和有效性。
抵押权实现影响公司财产：
- 即使出资时取得了抵押权人的同意，若出资人在出资后未能履行债务，抵押权人仍有权依法实现抵押权，对该财产进行拍卖、变卖等处分。这将导致公司失去该出资财产，进而影响公司的正常运营和财产安全。为应对此风险，公司应要求出资人提供充分的担保或保证，以确保在抵押权实现时公司有足够的救济措施。例如，可以要求出资人提供其他未设定抵押的财产作为担保，或要求其提供银行保函等第三方担保。
四、实际操作中的建议
解除抵押：
- 如果股东希望用某项资产出资设立公司，但该资产已设定抵押权，应首先与抵押权人协商解除抵押权。只有在解除抵押权后，该资产才能成为合法的出资标的。这是最直接、最有效的解决方式，可以避免后续可能出现的法律风险和纠纷。
选择其他出资方式：
- 如果无法解除抵押权或解除抵押权成本过高，股东可以选择其他合法的出资方式，如货币出资、知识产权出资等。这些出资方式不受抵押权限制，可以确保公司能够实际获得并使用出资财产。
五、实例分析
例如，甲以其名下已抵押给银行的一套设备向乙公司出资。在此情况下，甲必须首先取得银行的同意，并如实告知乙公司其他股东该设备已设立抵押的情况。如果甲未能按时偿还银行贷款，银行有权行使抵押权，将该设备拍卖。为避免此类风险，乙公司应要求甲提供额外的担保或保证，如提供其他未设定抵押的财产作为担保或提供银行保函等第三方担保。
综上所述，虽然已设立抵押权的财产在特定条件下可以用于出资，但公司应谨慎对待此类出资行为，确保满足所有法律要求和程序，并采取必要的风险防范措施以保护公司和股东的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。