行政复议申请人申请撤回行政复议申请后，原案件的处理方式主要取决于行政复议机构的审查结果，具体分为以下两种情况：

1. 若行政复议机构准予撤回
   根据《中华人民共和国行政复议法实施条例》第三十八条，若申请人撤回申请经行政复议机构审查认为合理（如不存在胁迫、欺诈等情形），且不损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益，行政复议机构将终止行政复议审查，原行政行为（如行政处罚、行政许可等）的效力恢复至申请前的状态。此时，原案件的法律程序终结，行政机关此前作出的具体行政行为继续有效。

2. 若行政复议机构不准予撤回
   若行政复议机构认为撤回申请可能损害公共利益或他人权益（例如，申请人因受胁迫而撤回，或案件涉及重大公共利益），则可能不准予撤回，并继续审查原行政行为的合法性。此时，行政复议程序将按原计划进行，最终可能作出维持、撤销或变更原行政行为的决定。

补充说明：

• 撤回的自愿性要求：申请人撤回申请必须完全自愿，若存在被胁迫、欺诈等情形，行政复议机构有权不予准许。
  
• 对原行政行为效力的影响：撤回申请仅终止复议程序，不直接否定原行政行为的效力。若原行为违法，需通过复议决定或行政诉讼另行撤销。
  
• 后续救济途径：若申请人撤回后反悔，仍可重新申请行政复议（需符合法定条件）或直接提起行政诉讼，但需注意诉讼时效限制。

建议：若您面临此类情况，建议先明确撤回申请的真实意图及潜在风险，必要时可提供具体案情，我将进一步分析撤回的合法性与可行性。