在起诉公司时，发现多个员工的私卡转入公司股东账户这一情况，核心结论是：这一情况可能成为证明公司财产与股东财产混同、股东滥用权利等的关键证据，但需要进一步收集和整理相关证据，并采取恰当的诉讼策略。以下从不同角度展开分析：

从证据收集角度

1. 收集转账记录：要尽可能全面地收集这些员工私卡转入公司股东账户的转账记录，包括转账时间、金额、转账附言等信息。这些记录可以通过银行流水、电子回单等方式获取，它们是证明资金流向的直接证据。
2. 获取员工证言：与相关员工进行沟通，了解他们转账的原因、背景等情况，并争取让他们出具书面证言或者出庭作证。不过，在获取员工证言时要注意方式方法，避免侵犯员工的合法权益，同时也要考虑到员工可能因为各种原因不愿意配合的情况。
3. 调查资金用途：进一步调查这些转入股东账户的资金用途，看是否用于了公司的正常经营，还是被股东个人挪用。可以通过查阅公司的财务账目、合同、发票等相关资料来辅助调查。

从法律分析角度

1. 公司财产与股东财产混同：如果这些转账行为导致公司财产与股东财产无法清晰区分，可能构成公司财产与股东财产混同。根据《公司法》的相关规定，公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。在这种情况下，你可以将股东列为共同被告，要求其对公司债务承担连带清偿责任。
2. 股东抽逃出资：如果这些转账行为被认定为股东抽逃出资，那么股东也需要在抽逃出资本息范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任。要证明股东抽逃出资，除了转账记录外，还需要证明股东存在虚构债权债务关系、利用关联交易等方式将出资转出等行为。
3. 挪用资金罪（如果涉及刑事犯罪）：如果股东利用职务上的便利，将公司资金挪归个人使用，数额较大、超过三个月未还，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动，或者进行非法活动的，可能构成挪用资金罪。在这种情况下，你可以向公安机关报案，追究股东的刑事责任，同时也可以在民事诉讼中主张股东承担相应的民事赔偿责任。

从诉讼策略角度

1. 明确诉讼请求：在起诉时，要根据收集到的证据和法律分析，明确自己的诉讼请求。如果认为股东存在财产混同、抽逃出资等行为，可以要求股东对公司债务承担连带责任或者补充赔偿责任。
2. 合理确定被告：除了将公司列为被告外，要根据具体情况合理确定股东是否为共同被告。如果股东的行为符合上述法律规定的情形，应当将股东列为共同被告，以增加自己获得赔偿的可能性。
3. 申请财产保全：为了防止股东转移财产，保障自己的债权能够得到实现，可以在起诉时或者起诉后向法院申请财产保全，冻结股东的相关财产。

在处理这类案件时，情况可能会比较复杂，如果你还有其他疑问或者需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。