作为负责人，当收到员工在试用期主动提出离职的申请时，我会按照以下步骤和思路来回复和处理，以确保流程的顺畅和双方权益的保障：
一、及时回应与确认
首先，我会尽快对员工的离职申请给予回应，无论是通过邮件、电话还是当面沟通，都要明确表示已收到其离职申请，并感谢其为公司所做出的贡献。同时，我会确认员工提出离职的具体原因，以便更好地理解其决定，并为后续的工作交接和离职流程做好准备。
二、解释离职流程与规定
接下来，我会向员工详细解释公司的离职流程和相关规定，包括需要提交哪些材料、工作交接的具体要求、离职手续的办理时间等。特别是要强调，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条的规定，员工在试用期内提前三日通知用人单位，即可解除劳动合同。我会确保员工了解这一法律规定，并明确其离职的合法性和正当性。
三、安排工作交接与离职面谈
在确认员工离职意愿后，我会立即安排其与接手工作的同事或领导进行工作交接。这包括整理手头的工作、相关文件和资料，并详细说明工作进展和注意事项。同时，我会提议进行一次离职面谈，以了解员工对公司的看法和建议，为公司的改进和发展提供参考。
四、办理离职手续与结算
在员工完成工作交接后，我会按照公司的规定为其办理离职手续，包括归还公司财物、结清工资和福利等。我会确保所有手续都办理得妥当且及时，以避免给员工带来不必要的麻烦。
五、正式回复示例
以下是我可能会给员工的一个正式回复示例：
“XX（员工姓名），
我已收到你关于在试用期提出离职的申请，并对此表示理解。感谢你在公司期间所做出的贡献和努力。
根据公司的离职流程和相关规定，你需要提前三日通知公司，并完成工作交接和离职手续。在此期间，我会安排你与接手工作的同事进行详细的交接，并确保所有工作都能顺利过渡。
同时，我也希望你能在离职前与公司进行一次面谈，分享你在公司期间的感受和建议，这将对我们公司的改进和发展非常有帮助。
最后，我会按照公司的规定为你办理离职手续，并结清所有工资和福利。祝你未来的职业生涯一切顺利！
如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时与我联系。”
通过这样的回复和处理方式，我能够确保员工的离职流程顺畅进行，同时维护公司的利益和形象。