针对您提出的问题，即在一个厂工作了16年，但离职证明上却只写了两年，这显然是不符合实际情况的，也可能给您未来的再就业或相关权益带来困扰。以下是我为您详细分析的解答：
首先，根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条以及《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十四条的规定，用人单位在解除或者终止劳动合同时，应当出具解除或者终止劳动合同的证明，也就是我们通常所说的离职证明。这份证明应当写明劳动合同期限、解除或者终止劳动合同的日期、工作岗位以及在本单位的工作年限等关键信息。
在您的情况下，离职证明上只写了两年，而您实际工作了16年，这明显违反了上述法律法规的规定。离职证明上的工作年限是证明您与原用人单位劳动关系存续时间的重要依据，对于您未来的再就业、社保缴纳、工龄计算等都有着至关重要的影响。
那么，为什么会出现这种情况呢？可能的原因有多种，比如用人单位的疏忽、故意隐瞒以规避某些责任，或者是内部管理混乱等。但无论原因如何，这种做法都是不合法的，也是对您权益的侵害。
针对这种情况，我建议您采取以下措施：
与用人单位沟通：首先，您可以尝试与用人单位进行沟通，说明实际情况，并要求其重新出具符合法律法规规定的离职证明。在沟通时，您可以引用相关的法律法规，以增强自己的说服力。
申请劳动仲裁：如果与用人单位沟通无果，或者用人单位拒绝重新出具离职证明，您可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁。劳动仲裁机构会根据相关法律法规和事实情况，对争议进行裁决，并要求用人单位重新出具离职证明。
寻求法律援助：如果您在处理过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业的法律援助。律师或法律援助机构可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助您维护自己的合法权益。
最后，我想强调的是，离职证明是劳动者与用人单位劳动关系终结的重要证明文件，对于劳动者的权益有着至关重要的影响。因此，在离职时，劳动者应当要求用人单位出具符合法律法规规定的离职证明，并妥善保管。如果遇到用人单位出具不符合规定的离职证明的情况，劳动者应当及时采取措施维护自己的权益。