在处理员工医疗期满后被公司辞退的赔偿问题时，我们首先要明确的是，这涉及到合法解除与违法解除劳动合同两种不同情形，它们的赔偿标准是截然不同的。

一、合法解除劳动合同的情形及赔偿

如果员工在医疗期满后，确实无法从事原工作，也无法胜任公司另行安排的工作，那么公司有权在提前三十日以书面形式通知员工，或者额外支付一个月工资作为代通知金后，解除劳动合同。在这种情况下，公司需要按照员工在本单位的工作年限来支付经济补偿。具体标准是：每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的则支付半个月工资。这里的月工资，指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。如果员工的月工资高于当地上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿将按照职工月平均工资的三倍来支付，且最高支付年限不超过十二年。

举例说明：假设一名员工在公司工作了3年，月平均工资为5000元，且其月工资并未超过当地上年度职工月平均工资的三倍。那么，如果公司合法解除劳动合同，应支付的经济补偿金就是3个月工资，即3×5000=15000元。

二、违法解除劳动合同的情形及赔偿

如果公司未遵循法定程序，比如未提前通知或未支付代通知金就直接辞退员工，或者员工实际上能够胜任新工作却被辞退，那么这种辞退行为就构成了违法解除劳动合同。在这种情况下，公司需要按照经济补偿标准的两倍向员工支付赔偿金。也就是说，每满一年需要支付两个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的则支付一个月工资的两倍作为赔偿。

举例说明：继续以上述员工为例，如果公司违法解除劳动合同，那么需要支付的赔偿金就是经济补偿金的两倍，即15000×2=30000元。

三、实际操作建议

1. 明确辞退性质：在处理此类纠纷时，首先要判断公司的辞退行为是否合法，这是确定赔偿标准的关键。
2. 计算具体金额：根据辞退的性质和员工的工作年限、月工资等因素，准确计算应支付的经济补偿或赔偿金。
3. 咨询专业律师：鉴于劳动法律关系的复杂性，建议在处理此类问题时咨询专业律师，以确保自己的权益得到充分保护。

四、维权途径

如果员工认为公司的辞退行为不合法，或者对赔偿金额有异议，可以通过以下途径来维护自己的合法权益：

• 与公司协商解决；
• 向当地劳动监察部门投诉；
• 申请劳动仲裁；
• 如对仲裁结果不服，还可以向法院提起诉讼。

综上所述，处理员工医疗期满后被公司辞退的赔偿问题，需要严格区分合法与违法解除劳动合同的情形，并依据相关法律法规来准确计算经济补偿或赔偿金。希望这些信息能对您有所帮助。