结论：项目负责人在项目中虚假做工资套钱，若数额较大或存在其他严重情节，公安机关是可以立案的。
分析说明：
法律定性：
- 项目负责人虚假做工资套钱的行为，可能构成职务侵占罪或诈骗罪等刑事犯罪。职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。诈骗罪则是指以非法占有为目的，用虚构事实或者隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为。
立案条件：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关对于报案、控告、举报和自首的材料，应当按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候，应当立案。因此，如果项目负责人虚假做工资套钱的行为涉嫌犯罪，且数额较大或存在其他严重情节，公安机关在审查后认为符合立案条件的，就会依法立案。
数额与情节：
- 具体是否立案，还会考虑到涉案金额的大小以及情节的严重程度。一般来说，如果涉案金额较大，或者存在多次套取、手段恶劣、造成严重后果等情节，公安机关立案的可能性就会增加。
法律后果：
- 如果项目负责人被立案侦查并最终被定罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。同时，其个人声誉和职业生涯也会受到严重影响。
行动建议：
- 对于公司而言：如果发现项目负责人存在虚假做工资套钱的行为，应立即收集相关证据，并向公安机关报案。同时，公司也应加强内部管理，完善工资发放和财务审核制度，防止类似事件再次发生。
- 对于项目负责人而言：如果意识到自己的行为可能构成犯罪，应立即停止并主动向公司坦白，争取从轻处理。如果已经被公安机关立案侦查，应积极配合调查，如实陈述事实，争取宽大处理。
后续思考：
- 在处理此类案件时，还需要考虑是否存在其他共犯或协助者，以及他们是否也应承担相应的法律责任。
- 同时，公司也应反思自身在管理和监督方面是否存在漏洞，以便及时采取措施加以改进。
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