结论：按劳动算工资时扣底薪是否合法，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
合法情形
员工存在过错或违反规章制度
- 法律解释：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 举例：若员工因疏忽导致公司财产损失，公司根据规章制度和劳动合同约定，从员工工资中扣除一定比例作为赔偿，且扣除后工资不低于最低工资标准，这是合法的。
双方协商一致并书面约定
- 法律解释：根据《劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。若双方在劳动合同或补充协议中明确约定了扣底薪的条件和方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么按约定扣底薪是合法的。
- 举例：双方在劳动合同中约定，若员工未完成特定业绩目标，公司有权从其底薪中扣除一定比例作为惩罚，且该约定不违反法律法规，那么这种扣除是合法的。
非法情形
无合法依据扣除底薪
- 法律解释：若用人单位无法提供员工存在过错、违反规章制度或双方协商一致的证据，而擅自扣除员工底薪，这违反了《劳动法》和《劳动合同法》中关于工资支付的规定，属于非法扣除。
- 举例：公司无故以“市场不景气”为由扣除员工底薪，且无法提供合法依据，这种扣除是非法的。
扣除后工资低于最低工资标准
- 法律解释：根据《劳动法》第四十八条，国家实行最低工资保障制度。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。若扣除底薪后员工的工资低于当地最低工资标准，即使存在合法扣除的理由，这种扣除也是非法的。
- 举例：员工月工资为3000元，当地最低工资标准为2500元。公司因员工过错扣除其底薪500元后，员工工资变为2500元（假设无其他扣除项），虽未低于最低工资标准，但若再扣除其他费用导致工资低于2500元，则这种扣除是非法的。不过，若一开始扣除的底薪就使得工资低于最低工资标准，如扣除600元后工资为2400元，那么这种扣除直接就是非法的。
建议：
- 若您遇到公司非法扣除底薪的情况，首先与公司协商解决，要求公司说明扣除理由并提供相关证据。
- 若协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 在签订劳动合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于工资支付和扣除的约定，确保自己的权益不受侵害。
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