总公司在海外、分公司在国内的情况下，签订两份合同本身并不异常，但具体是否合法、合理，需结合合同内容、签订目的及适用法律等多方面因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同签订主体与目的角度
主体合法性：
- 海外总公司与国内分公司作为两个独立的法律主体（尽管分公司可能不具有独立法人资格，但通常具有签订合同的相对独立性），基于各自的经营需要或业务安排，分别签订合同是可能的。
- 关键在于确认国内分公司是否具备签订该合同的主体资格，即是否在其经营范围或授权范围内行事。
签订目的：
- 如果两份合同是为了明确不同业务环节的责任、权利与义务，或者基于税务、外汇管理、风险隔离等合法目的而签订，那么这种安排是合理的。
- 若签订两份合同是为了逃避法律义务、规避税收或进行其他非法活动，则显然是不合法的。
二、合同内容与法律适用角度
合同内容：
- 两份合同的内容应各自独立且完整，不得存在相互矛盾或冲突之处。
- 合同条款应明确、具体，符合相关法律法规的规定，不得损害国家、社会公共利益或第三方合法权益。
法律适用：
- 如果两份合同分别约定适用不同国家的法律，需确保该约定不违反中国法律的强制性规定和社会公共利益。
- 在无特别约定的情况下，根据国际私法规则，可能会适用与合同有最密切联系的国家或地区的法律。对于国内分公司签订的合同，通常优先考虑适用中国法律。
三、实际操作与合规性角度
外汇与税务合规：
- 如果两份合同涉及跨境交易或支付，需确保符合中国外汇管理的相关规定，如外汇支付渠道合法、报备手续完备等。
- 同时，应关注税务合规性，确保按照中国税法规定履行纳税义务，避免双重征税或逃税风险。
内部审批与备案：
- 海外总公司与国内分公司在签订重要合同时，应履行内部审批程序，确保合同签订符合公司章程或内部管理制度的要求。
- 对于某些特定类型的合同（如涉及重大资产处置、对外担保等），可能还需向相关部门进行备案或审批。
四、法律后果与风险防范
法律后果：
- 如果两份合同存在违法情形，可能面临被认定无效、被撤销或承担法律责任的风险。
- 违法合同还可能损害公司声誉，影响业务合作与市场拓展。
风险防范：
- 在签订两份合同前，应进行充分的法律尽职调查，确保合同内容合法、合规。
- 必要时，可聘请专业律师对合同进行审查，提供法律意见或建议。
- 在合同履行过程中，应密切关注法律法规的变化，及时调整合同条款或履行方式，以降低法律风险。
总结与建议：总公司在海外、分公司在国内的情况下签订两份合同，本身并不构成问题。关键在于确保合同签订主体合法、目的正当、内容合规，并关注外汇、税务等实际操作中的合规性问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。